平凡的大學生金木研因為遭到喰種獵食而性命垂危，某位醫生為他進行了器官移植手術，但是器官提供者其實是獵食他的喰種。
在病床上醒來的金木研很快就感覺到身體不對勁，原本記憶中美味的食物全都惡心到難以下咽。
一開始，即使好幾天不吃東西他也不會餓，但不久，激烈的空腹感開始折磨他。
當他意識到，能引起他食欲的對象只剩下街上擦身而過的男男女女，他絕望的日子也就此開始……
在痛苦與掙扎的食人過程中金木的實力不斷變強直至成長為了SSS級喰種，并在此過程中逐漸收獲了屬于喰種一方的友情與事業。
但可惜好景不長，金木研在后續某次CCG搜查官的喰種圍剿行動中不幸被俘，并且因為在之前的戰斗中被CCG最強特等搜查官有馬貴將的庫因克捅進大腦這種物理性原因而喪失了一部分記憶，之后更是被CCG方面通過特殊技術塑造了一個新的搜查官人格，并化名為佐佐木琲世。
剛成為CCG三等搜查官的佐佐木琲世，一直跟隨真戶曉學習一等搜查官的搜查技術。
兩年后，佐佐木已已經可以獨當一面并成為一等搜查官，但卻因為某次任務需求而逐漸覺醒了女裝的愛好，平時是“昆克斯班（獨眼喰種搜查官小隊）”的指導者，帶領著四名下屬（半喰種）進行各種搜查工作。
之后，佐佐木琲世在討伐月山集團時覺醒了屬于金木研的記憶與力量，擊敗了獨眼梟，成為準特等搜查官，并離開昆克斯班，加入有馬班。
再之后，徹底恢復金木研身份的佐佐木琲世為了救出被關在庫克利亞的雛實，只身面對“不敗的搜查官”，擊敗有馬貴將后創立了新的喰種集團“黑山羊”，并成為了新的“獨眼之王”。
在“黑山羊”被殲滅后，由于其理念作為影響“黑山羊”和CCG時期的同僚，進而促成CCG和“黑山羊”組成聯合作戰的同盟“共同戰線”對抗主謀“V”組織和“小丑”。
金木研則前往位于地底的巨大迷宮“24區”獨自面對和修之龍，親自終結“V”組織和“小丑”的陰謀。
“龍戰”落幕的六年后，CCG東京分部重新組織為“TCG（東京保安委員會TokyoSecurityCmittee）”。
昔日CCG成員和“黑山羊”組成聯合作戰的同盟“共同戰線”，成為促進人類和喰種平等共處合作的核心組織。
金木研為持續實踐人類和喰種平等共處的理念，擔任“共同戰線”的協助者……】
“東京喰種？食尸鬼？第一個祈愿任務是食人鬼，第二個祈愿任務是食尸鬼？總感覺站點抓取的這些祈愿世界似乎對我（的尸體）充滿了某種無法言說的惡意與**。”