但無論征伐高麗的軍事收獲如何，是勝是敗，楊廣大肆濫用民力，搞得全國不堪重負民不聊生確是不爭的事實。
為了做出征的準備，先是在大業七年三月命令幽州總管元弘嗣到東萊海口造船三百艘，官吏們督促工程，工匠、役丁們晝夜站立在水中，不敢停下稍微休息一下，自腰以下都生了蛆，病累而死去的人有十之三、四；四月征發天下兵卒，無論遠近，都在涿郡集中。又征發江淮以南的水手一萬人，弩手三萬人，嶺南排镩手三萬人，于是從全國各地奔赴涿郡的兵卒川流不息；五月，命令河南、淮南、江南等地制造兵車五萬輛送往高陽，作為后勤運輸車輛，征發河南、河北民夫以供應軍需。七月，征發江、淮以南民夫以及船只運輸黎陽和洛口各糧倉的米到涿郡。水上運輸船只首尾相連綿延千余里。陸上運載兵器鎧甲以及攻城器械的人常達幾十萬人。擁擠于道，晝夜不停，病累而死的人互相枕著，路上到處散發臭氣。堪稱全國總動員，不寧累雞犬。
更嚴重的是，由于這種戰爭準備，必然涉及到物資的征收，官吏貪狠暴虐，借機漁肉百姓，百姓窮困，財力枯竭。加上徭役繁重，錯過農時，造成田地荒蕪，谷價上漲。當年又有水災，黃河也被堵塞，倒流幾十里。這個時候，安分守己則無法忍受饑寒，死期也將迫近；搶劫掠奪則還可能活命，大規模的農民起義開始爆發。
大業九年二征高麗時，由于已經經歷過一次戰火，更多的人有了厭戰情緒，尤其是王薄作《無向遼東浪死歌》，勸大家不要去邊關送死，不僅是民夫逃亡，連軍中的士卒也紛紛投奔，很快就聚起了十余萬人的隊伍。這只是一個代表，與此相對應的是在大業七年之前，幾乎沒有什么起義軍，大家對楊廣的窮奢極欲都能默默忍受，征伐高麗，成為了壓倒楊廣的最后一根稻草。當然，這根稻草頗有些沉重。
三征高麗時，楊廣所召集的部隊很多都未能到位。固然是由于路上盜匪橫行，官軍不易通過，但也有很多官軍直接脫了軍裝（甚至穿著）當盜匪。楊廣的政權已經搖搖欲墜，之所以草草結束這次征伐，這也是主要原因。