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賊人剿之不盡，這邊的賊人剿滅了，那邊又有新的賊人出現，在明軍眼中，人民軍也是賊人。
官府、地主還有這賊人，是老百姓最厭惡的對象，居住在城池內的老百姓還好一些，起碼遠離賊人，但居住在城外的老百姓就無法避免了，即便是搶走老百姓的糧食，對老百姓們來說就是要了自己命一般。
在人民軍之前，要是老百姓遇到好一點的官員，出現賊人后會被迅速派兵剿滅，遇到差一點的官員，只要賊人不做大不惹出大事，官員都不會去管，只是苦了老百姓。
可惜，即便賊人被剿滅了，在官府和地主的壓迫下，賊人依舊會源源不斷出現，當初受到賊人欺負的老百姓，也有一天成為賊人。
人民軍想要將一個縣徹底控制住，在攻占縣城、剿滅城外地主莊園之后，還要將縣內的賊寇全部剿滅，剿滅賊寇也會讓人民軍得到老百姓的擁戴。
實際上剛開始占領一縣的時候，人民軍并沒有立即清剿賊寇，那些賊寇在發現縣城被強大的“賊人”占領后，以為機會到了，立即出山劫掠村莊，還有賊寇竟然找到人民軍想要加入。
在這種情況下，人民軍才定下剿滅地主莊園后就開始清剿賊寇的步驟，并且在每個村莊招募新兵的時候，新兵會就地訓練，并且村莊中沒有參軍的青壯也要跟著訓練，平日里組成護村隊，防備有賊寇來襲。
對于少部分從來沒有欺負過老百姓的賊寇，人民軍以勸降為主，這種賊寇多是因為官府和地主的欺壓，才成為賊寇，往往只會對官府和地主大戶下手，只不過這種賊寇多數實力較弱，大部分時候都是待在山里種田。
只要賊寇投降，又沒有欺負過老百姓，人民軍對他們的處理非常寬松，運行他們回到曾經的家園，給所有人分配農田，開始新的生活。
那些欺負過老百姓的賊寇，就算主動加入人民軍，人民軍也會仔細審查，凡是做過惡的都要被處罰，嚴重者處死，輕者會送到礦山挖礦，或者進入先登營，沒有做過惡的人，可以選擇加入人民軍，也可以選擇回到老家種田。
在清剿賊寇的時候，人民軍也有遇到明軍的麻煩，賊寇的山寨在大山中，往往易守難攻，看到敵人來襲，會迅速逃往深山，很難清剿掉。
好在人民軍原本就是大量山民組成，對山林非常熟悉，而且大部分人民軍的衣著都是破舊衣衫，和官軍很大不同，山賊看到了還以為是其他伙山賊，人民軍可以打個措手不及。
當然，人民軍清剿山賊的主力依舊是火器部隊，不需要多，只要一個排的火器部隊配合上百或者數百冷兵器部隊，就能拿下大部分山寨。
要是遇到大股山賊，那人民軍就要聚集一個縣大部分兵力過去清剿。
新占領的興寧縣、和平縣、長寧縣、惠來縣、普寧縣五縣，人民軍第一混成旅和第二混成旅就是按照這樣的步驟對五個縣快速控制起來，并且讓老百姓迅速接受人民軍，一部分老百姓已經已經是真心歡迎人民軍的出現。
消化掉這五個縣之后，人民軍也要盡快發展自身實力，人民軍的偵察兵深入到明朝治下活動，已經發現多股明軍正在聚集，預計這些明軍的目標都會是人民軍，用不了多久，人民軍與明軍的第二場大戰就會到來。