崇禎怒道：“好心？這是什么好心，又是劃地盤，又是給種子的，這是讓流寇寄居在大明身上！到了某個時刻，就給朕鬧出一個簍子！”
溫體仁回道：“那陛下是要拒絕嗎？如此，流寇牽扯我們大部分精力，北方的女真韃子怕是會趁機攻打我們了。”
崇禎閉眼嘆氣道：“此事先拖著，讓山西各路官兵繼續剿匪。”
此事擱置后，劉元昭見明廷沒有回音，便讓蘇泰豐返回。
十一月，高迎祥、李自成、張獻忠、羅汝才等突破明軍防線，于毛家寨渡黃河，陷澠地。十二月下宜陽、盧氏、內鄉至南陽(今皆屬河南)遂入湖廣。破夔州(今四川奉節)逼四川。明軍所在告急。
這時候崇禎急了，他連忙派人去找劉元昭，希望他派人去與流寇談判，讓他們接受明廷招撫。
劉元昭將書信擱置，對此事不理不睬。
因此，崇禎再度怒斥劉元昭背信棄義，意欲切斷互市。
首輔溫體仁趕緊勸慰道：“陛下，如今我們已經與女真韃子敵對，如果再惹怒劉元昭，那真是不堪重負了！陛下三思！”
崇禎怒視溫體仁，說道：“就把糧食等緊俏物資攔下，如今朝廷正是缺糧食，為何這些商人還有糧食出口國外？
都是奸商，讓錦衣衛給朕查，抓起來，抄家！全部充公！”
劉元昭對于崇禎的舉動很是不滿，于是派人向遼東地界散布明廷內部的不少重要消息。
十二月，甘肅西和有約六級地震，震中烈度為七至八。
劉元昭治下歸德都督府的洮州衛和臨洮府都有震動。
此事一發生，言官皆言此事是崇禎德行不夠，上天懲罰，崇禎不得已下了罪己詔，平息各路言論。
很快，崇禎六年過去，崇禎七年到來，廣鹿島(位遼東半島東南海中)副將尚可喜降于金。
尚可喜字元吉，號震陽，祖籍山西洪洞，后至河北衡水，明萬歷四年（1576年）其祖父尚繼官舉家遷往遼東海州（今遼寧海城）。
尚可喜戎馬一生，身經百戰，轉戰數萬里，為清王朝的建立和鞏固立下了汗馬功勞，在清代歷史上寫下了濃重的一筆。
康熙年間，晉封為平南親王。康熙十五年（1676年）十月二十九日，平南王尚可喜在廣州薨逝，享年七十三歲。康熙皇帝賜謚曰敬。
孔有德在海上被黃龍殺得抱頭鼠竄，損兵折將，認為是平生奇恥大辱，發誓必報此仇。待得安頓好部屬，就攛掇皇太極攻打旅順。
皇太極一直也以明軍占據旅順威脅沈陽南路耿耿于懷，孔有德此議正中其下懷。崇禎六年六月，皇太極命貝勒岳托、德格類、多鐸，漢軍石廷柱等率馬步兵一萬出擊旅順，孔有德、耿仲明率所部隨征。
自從尚可喜皮島救駕后，黃龍甚為感激，委以重任，信用甚專。海上堵截孔耿，尚可喜勇打頭陣，斬獲甚重。
孔耿逃脫后，黃龍命尚可喜駐防鹿島，離旅順約有六七百里，三五天內兩下里接應不上。七月初四，后金軍從陸路由北而南圍攻旅順。黃龍得報，知道來者不善，急忙派人出海調尚可喜回援，同時奮力抵抗。
堅守三日之后，七月初六，后金軍攻上旅順城，黃龍仍然指揮部隊殊死戰斗，被圍數重，苦戰不得出。
眼看突圍無望，黃龍將朝廷賜給他的征虜前將軍印信交給部將譚應華，用他耳鼻盡失后特有的音質含混不清地叮囑，讓譚應華奮力突圍，把印信帶到登州上交朝廷，如沖不出去，就將印信丟入大海，說完之后，向南跪拜，自刎而亡。
守城明軍數千人大部分陣亡，后金軍也死傷數千。尚可喜的家眷都在旅順，城破之后他的幾位夫人不甘受辱都投海而死。
黃龍生性貪鄙，當了東江總兵之后，私欲惡意膨脹，大肆吞剝軍餉，比毛文龍猶有過之，其貪欲之強之奇足可載入史冊，由此給了暗中窺視總兵之位的沈世魁利用兵變發難之機。
演武場上，一頓折辱，黃龍耳鼻盡失，威嚴掃地。后雖經尚可喜將其救出，但黃龍羞慚無地，五官不全，已無顏號令三軍。最后離開皮島這個傷心之地，率偏師來到旅順駐扎。