勇衛營拔營以后，浩浩蕩蕩開進了南京城，占據南三處軍營，將原本這四處軍營的駐軍都趕了出來。
城南那個地方，還不只是駐軍在那里，亂得很，城內的明軍可以分為兩種，一是駐于城北的巡防軍，一就是駐于城南的常備軍。
簡單說來，現下駐扎在南京城南的大致可分為兩類。
一類是軍營。
如南門邊上邊營、南營、東營，就是被勇衛營入城后占據的，為永樂一朝設置，常駐此地，是南京的常備軍之一。
這三營常備軍，不負責平日里南京城的巡防、輪換，還有緝拿盜賊之事，除非城內起了叛軍，或者賊軍攻城，否則他們都是不動一步。
如今，邊營、南營、東營的兵力，都是南京城內那些勛貴在掌管，泰昌元年魏國公徐宏基上報的在冊人數是三營各五萬，總計十五萬。
朱由校沒去過，聽說還留下來的人數不多，而且大部分都被勛貴、世家子弟占了名額。
這三營的常備軍，要改制一番，把兵權從勛貴手里拿回來。
除卻這類常備軍和平日的巡防軍以外，另外一類即是明初至今匠營的遺存，因當年匠戶集中居住，統一管理，有類于駐軍。
延續至今，弊端盡顯。
三營常備軍只駐于城南，這次勇衛營入城，占了他們的駐地，所以盡都遷到城北巡防軍的幾處空營去了。
至于匠戶，則廣及南京城中以至城外。
如東門的木匠營，盡是永樂年間調往此處的木匠后人，其分布地點極廣，每年又要北上入京做輪班匠。
輪班匠制，還有在中國實行了近四個世紀的匠籍制，都是朱由校下來南京要廢除的舊制之一。
當然，舊制的廢除，需要新制的約束和替代，才能對當下有積極、正面的影響。
這些，朱由校都想的很清楚。
來南京，就是為了大刀闊斧的改革一番，就算不能讓南京變成安全穩定的大后方，也得讓這個江南給朝廷創造一些收入。
然后回去，和韃清開干。
匠籍制度的特點就是，但凡入了匠籍的匠戶，都被稱作軍匠，世代不能離開駐地。
一人脫離，全家連坐。
只要入了匠籍，除非當朝的皇帝另有旨意，大力改進匠戶制度，不然直至明亡，他們都要居住在匠營，不得出入。
南京城外有一條小溪，朱由校入城時還見過。
小溪的西岸駐扎著不少匠營，其中有個棉甲營，永樂年始置，延續至今，為軍隊制作棉衣、甲胄、棉鞋的作坊，也都分布在棉甲營駐地的兩側。
每年，棉甲營都要將新制作好的棉甲和鴛鴦棉衣，經漕運送抵九邊及遼東，給邊軍更換甲胄及防具。
軍器司自天啟元年以來，在天津衛、登萊港，都設置了不少作坊，雖然燒銀子，但作用已經越來越大。
截止天啟二年十月底，兵部上奏，九邊駐軍的盔甲和制式刀槍，已經全部完成新舊交替，熊廷弼也受到了三批次的新制遂發鳥槍、火炮。
在天津港的軍器司作坊，正對澎湖之戰繳獲的荷蘭戰艦、火炮進行研究，不日就能把人家的先進武器，仿制出來安裝到自己的水師上。
南京這些老舊的匠營，雖然現在看起來沒什么用處，但卻都是上好的“軍工廠”底子，只要稍加改制，就能把他們變成朝廷軍器司下屬的一個個工廠，發揮該有的作用。
會更燒錢，但是朱由校已經有了應對之法。
三年前加增沿河關稅，為朝廷每年帶來了幾十萬兩的收入，那是個試探，到如今，該進行商稅改革了。