按照朱由校的想法，中軍都督府還只是試水。
試試到底有誰反對，試試到底誰跳的最厲害，為此，朱由校甚至做出了大開殺戒的打算。
天下間沒有不流血的改革，既然現在時機成熟，更沒什么好猶豫和退縮的。
整頓中軍都督府，就和在山東推行新鹽法一樣，張維賢、溫體仁，都只是朱由校這副權利棋盤上的棋子。
說起組建五軍都督府，朱元璋的目的也很簡單，就是要利用五軍都督府，讓后世之君直接掌控武將。
掌控了武將，做什么都有底氣。
洪武初年，朱元璋以自己的侄兒朱文正擔任大都督，其最直接的目的，便是通過扶持朱文正，來確保軍權的掌控。
其實，朱元璋這種計劃帶有長期性，對初代甚至第二代的皇帝影響都不是很大。
因為從改制的人事調動來看，朱元璋首先是將諸將納入自己的直接掌握的中書省內，但中書省這種軍政合一的領導體制，只是為了適應戰時的需求。
一定程度上來說，就和朱由校利用崔呈秀臨時掌控兵部來間接性的收回兵權一樣，都是權宜之計，并不適合于將來的政權建設和皇朝延續。
而朱文正任職大都督府大都督，就可以確保之后中書省軍政分離，軍權繼續能夠掌握在朱元璋手中。
但是朱元璋沒想到，僅僅幾十年之后，一場土木堡之戰，摧毀了他的全盤部署。
朱祁鎮的紈绔自大，不僅葬送了統領五軍都督府的英國公張輔，也讓朱元璋留下來幫助歷代皇帝掌握兵馬的武勛集團徹底葬送。
在那之后，五軍都督府地位一落千丈。
兵部逐漸合并了五軍都督府的職權，軍政一體，某種方面又和明初的中書省類似。
甚至于到現在，五軍都督府完全已經形同虛設，全部的職權都已經被兵部接管。
五軍都督府的官職，對武將來說，只相當于“兼贈”，完全不需要述職，尋常軍務都由地方文官接手，再由文官上報兵部。
五軍都督府既不能管理武將的升遷調動，也不能插手衛所屯田和尋常操守，已經完全喪失了統管天下兵馬的職能。
朱由校現在要做的，其實只是恢復祖制。
有些祖制需要唾棄，朱由校沒有半點愧疚感，因為時代需要進步，同時，有些祖制則需要恢復。
五軍都督府直屬于皇帝，只要五軍都督府的職權仍在，皇帝就擁有對地方武將的直接控制。
手握兵馬大權的皇帝，足以改變很多事情。
換句話說，如果江南三衛反叛時，五軍都督府的職權仍在，很大程度上他們是鬧不起來的。
“英國公有異議嗎？”朱由校看了一眼張維賢，面色帶著略微的不滿，但語氣并不是很強硬。
張維賢只是一時驚呆，他自然知道整頓中軍都督府的影響。
“陛下圣明，臣無異議。”
“這樣就好。”朱由校輕輕的點頭，然后說道：
“既然要整頓中軍都督府，那在此之后中軍都督府下轄各衛所的屯種、操訓事務，悉都交由地方中軍都督府衙門接管。”
“中軍都督府下轄，各京衛、外衛所屬武將的升遷調動，俱都不用呈報地方督撫了，皆由中軍都督府衙門管理。”