在佑介正式擔任宇智波一族族長之后不久，火之國大名便在火之國都城召見三代火影、火影顧問以及佑介，共同商討關于提名佑介成為新任火影顧問的事宜。
在商議開始之前，大名單獨會見了佑介。
雖然佑介用「別天神」將意志強加給了大名，但是卻并不會改變大名的人格或是對常理的認知。
因此大名除了對佑介絕對信任外，其他的處事方式并沒有發生任何變化。這也是「別天神」這個幻術的神奇之處。
這次會見中，佑介直言不諱的批判了三代所領導的木葉管理層。在他們的管理之下，木葉短短幾年便從強盛走向了衰弱。
幾年之前，木葉還有白牙、三忍、黃色閃光、團藏以及宇智波富岳等等高手坐鎮，可謂是一時鼎盛，沒有哪個忍村敢捋木葉的虎須。
然而現在白牙自殺、三忍離村、黃色閃光昏迷不醒；團藏的根組織和宇智波一族也是自相殘殺，導致了團藏以及根組織覆滅，宇智波一族也是損失慘重。
這一切，無不說明三代火影以及他領導下的管理團隊的無能。
在佑介有理有據的分析以及「別天神」的影響下，大名完全認同了佑介的觀點，對三代火影以及現任的兩名火影顧問也十分的不滿。
借著這個機會，佑介提出了重組木葉管理層的方案，得到了大名的支持。
在之后與三代以及兩名火影顧問的會議當中，大名親自提出佑介規劃的木葉管理層重組的方案，在現有的基礎上又添加了首席顧問和名譽顧問兩個席位，來幫助火影進行決策。
雖說是‘幫助’，但是任何人都能看出這其實是在制衡火影，大大削弱了火影的話語權。
三代以及兩名顧問雖然提出了異議，但是在大名的堅持之下，最后也只得無奈妥協。
當佑介以及三代火影等人回到木葉之后，三代不得已將大名的提出的三項任命正式公布了出來。
這三項任命讓木葉所有人都無法置信，也讓所有勢力都察覺到到木葉的權利分配將會迎來新一輪的洗牌。
第一個項任命是指定現任宇智波一族族長宇智波佑介為首席火影顧問，首席火影顧問的地位要高于火影顧問。
任命的原因是嘉獎佑介破除了團藏以及根組織破壞木葉穩定的行為，并曝光了團藏以及根組織大量的罪行，同時也是為了紀念整個宇智波一族自參與建立木葉以來為火之國所做的貢獻。
第二項任命則是新增加一位名譽顧問。
大名對目前木葉高層的近年來的無所作為十分不滿，決定安排了一位名譽顧問代表大名監督木葉高層。當木葉高層在決策上出現重大分歧時，可以通過上報大名來做最終決定。
這位名譽顧問自然就是佑介為自己尋找的幫手，增加自己在高層決策時的話語權。
第三項任命則是一個全新的職位。木葉將新建‘木葉研究院’，專門進行忍術和忍具的開發，由佑介擔任該第一任院長并全權負責研究院的修建與運轉，同時原本隸屬于根組織的研究人員全部劃歸到木葉研究院中。
自此，宇智波一族正式回歸到木葉的政治核心，而宇智波佑介這個名字也傳遍了整個忍界。
現在的佑介已經身兼四個身份，火影首席顧問、木葉研究院院長、木葉警務部部長以及宇智波一族族長。
手握重權的佑介立刻開始整頓宇智波一族，將三名家族長老的權利全部收回，交由奏一郎和鼬來管理。