滿清承認朝鮮“完全無缺之獨立自主”，實則承認扶桑對朝鮮的控制；
滿清將遼東半島、臺灣島及所有附屬各島嶼（包括釣魚島）、澎湖列島割讓給扶桑。
滿清“賠償”扶桑軍費白銀六千萬兩。
開放沙市、杭州二地為通商口岸，扶桑政府得派遣領事官在以上各口岸駐扎，扶桑輪船得駛入以上各口岸搭客裝貨。
扶桑臣民得在中國通商口岸城市任便從事各項工藝制造，將各項機器任便裝運進口，其產品免征一切雜稅，享有在內地設棧存貨的便利。
扶桑軍隊暫行占領威海衛，由滿清政府每年付占領費庫平銀二十萬兩，在未經交清末次賠款之前，扶桑不撤退占領軍。
本約批準互換之后，兩國將戰俘盡數交還，滿清政府不得處分戰俘中的降敵分子，立即釋放在押的為扶桑軍隊效勞的間諜分子，并一概赦免在戰爭中為扶桑軍隊服務的漢奸分子，免予追究。
雖然通過一系列的暗中策劃，《馬關條約》賠款從2億兩白銀降低到6000萬兩白銀，少開放了重慶和蘇州兩個口岸，但是它依然是清朝簽訂最嚴重的不平等條約，給近代華夏社會帶來嚴重危害，東北三省，臺灣等大片領土的割讓，進一步破壞了華夏主權的完整，刺激了列強瓜分滿清的野心，民族危機進一步加深。
千萬別以為《馬關條約》簽定戰爭就結束了，戲肉還在后面。
《馬關條約》簽訂6天后，俄羅斯帝國因扶桑占領遼東半島，阻礙它向滿清東北伸張勢力，便聯合法、德兩國進行干涉。
第七天，大洋王國與法國因為扶桑國割讓臺灣，澎湖，嚴重侵犯了其利益，便聯和俄德干預。
1895年5月31日
扶桑宣布放棄遼東半島，但要滿清以白銀1000萬兩將其“贖回”。
扶桑宣布放棄臺灣，澎湖，要滿清以白銀300萬兩將其“贖回”。
經過討價還價，滿清以白銀1000萬兩將遼東半島和臺灣澎湖“贖回”，結束了這場瓜分東亞鬧劇。
螳螂捕蟬，黃雀在后。
“三國干涉還遼”，“四國干涉還臺”對扶桑來說是飛來橫禍，被大洋王國耍來耍去令其蒙受了極大的恥辱，原本藉由甲午中日戰爭獲勝之機侵占滿洲，臺灣的企圖遭到粉碎，也使俄國增強其在遠東的勢力，遏制了扶桑在朝鮮的擴張。
為了實現扶桑國“大陸政策”的第二步（吞并朝鮮）和第三步（進軍滿蒙），扶桑重新整軍備戰，決定于十年后發動對俄羅斯帝國的陸地戰爭。
至于大洋王國，由于扶桑國海軍實力不濟，暫時還威脅不到位于南太平洋深處的大洋王國，氣的干瞪眼沒轍。
甲午一戰，扶桑成為亞洲的暴發戶。
可原本歷史上能獲得戰爭賠款二億三千萬兩庫平銀，艦艇等戰利品的價值也有一億多日元，總共三億五千多萬，如今只剩下戰爭賠款白銀7000萬兩，而且還丟了臺灣，澎湖諸島，并不能滿足扶桑貪婪的胃口。
好在扶桑國政府并不知道被算計了，原本窮慣了的島國，自我感覺此次甲午戰爭的收獲也不錯，畢竟有7000萬兩白銀入帳，怎么看都是賺的。
扶桑外務大臣陸奧宗光高興地說：“在這筆賠款以前，根本沒有料到會有好七千萬兩白銀，政府全部收入只有八千萬日元。所以，一想到現在有這么多錢滾滾而來，無論政府還是私人都頓覺無比的富裕。”