佛郎機海戰名將阿方索選擇了投降，他舉起了白旗。
而大明的指揮者汪宏也傳令大明各戰船停止了炮擊，并著人將阿方索等人俘虜到了自己的戰艦上，同時下令登陸。
在汪宏率領大明水師登陸滿剌加巴淡島后，大明派駐滿剌加的總理大臣與滿剌加流亡貴族賓塘王公登陸了巴淡島。
在正德九年，滿剌加被大明從佛郎機手中收復，但也標志著，滿剌加從此進入了大明與滿剌加地方貴族共同統治的時代，大明更像是在太上皇，是滿剌加的實際統治者，而滿剌加的王室則更像是傀儡。
大明幫滿剌加復國后，按照朱厚照的要求，傅珪在滿剌加都城建立大明總理衙門，并設置各級官吏，同時傅珪兼領滿剌加長史，奉旨領各級官吏讓賓塘王公以儒家禮儀即位為王，而即位之時重要的儀式則是宣讀大明皇帝授予賓塘王公為滿剌加元首，總理大臣為滿剌加最高軍政長官的旨意。
傅珪一心要幫滿剌加建立儒家理學秩序，也沒想過皇帝朱厚照的這道旨意里給予了他這個大明臣子管控整個滿剌加的權力，但也正因為此，讓他這個理學名臣在滿剌加有了充分的發揮，他直接下令讓滿剌加去掉了所有波斯文化符號，也把波斯的建筑全部拆掉，同時要求滿剌加實行府縣制，統一使用漢文，并強令在各縣設立社學，開創科舉制度。
因為滿剌加元首賓塘從大明國子監畢業后，更是被傅珪強行要求每日進行經筵，而且在那個時候，滿剌加本土已有許多大儒，這些大儒比傅珪還要古板頑固，強行要求滿剌加國王做一符合儒家禮儀的賢王。
傅珪本來只是想在滿剌加以儒立國，但卻不知不覺間，讓滿剌加還跟著漢化了，除此之外，連滿剌加的貨幣也與大明一樣，全部使用大明皇家銀行統一制作的銀元，銀元乃是太祖朱元璋的頭像，以至于朱元璋多年后在滿剌加的知名度已經蓋過了當朝國王。
當然，傅珪的這一系列舉措并沒有引起滿剌加土著多大的反抗，一是因為佛郎機把這里先屠了一遍，二是殘余的滿剌加貴族在因為大明還承認起統治者身份的情況下也都沒有了和大明作對的想法，畢竟他們也知道佛郎機尚且能讓他們失去剝削滿剌加土著的機會，何況是大明，為了不再做一個流亡在各大孤島上的貴族，這些滿剌加的貴族們都接受了大明在滿剌加的太上皇地位。
大明帝國開始瘋狂在滿剌加挖取礦石，甚至直接冶煉重污染產品，以至于后來還要直接攫取這里的橡膠資源，但這些都是通過滿剌加地方統治者之手，因而滿剌加當地一些不堪忍受被剝削的庶民們只痛恨著滿剌加的地方統治者。
反而因為大明的官府與資本家在利用這些廉價的滿剌加勞動力同時還給予了其少量的報酬，使得這些滿剌加庶民還感激大明，甚至向往能成為大明的百姓。
正德十年，朱厚照正式下詔，天下兵馬改稱陸軍與海軍，其中大明兩廣水師整編南海艦隊，而南海艦隊之一部則駐扎于滿剌加海城即今天的新加坡。
因為，在朱厚照的授意下，滿剌加已正式同意將海城租借給大明作為軍事基地，租借期為九十九年，租金是一年一銀元。
所以，大明的海軍現在可以合法地駐扎在這里，當然，對于若干年后一些人說大明這是在殖民該地區，大明是不會承認的，因為若干年后，連海城的本土居民都在感激大明，認為是大明給了他們人權，給了他們先進的制度與思想，讓他們擁有了繁華。
正德十一年，朱厚照再次下詔，因百姓遷徙難以禁絕且禁絕也不利于百姓謀生之故，而取締路引制度，準予百姓辦理戶籍遷移，同時鼓勵百姓墾荒以及北上與出海，以至于遠至漠南以北瓊州以南，大明百姓越來越多，漢人也越來越多。