這個獨立團的編制出來之后，連蘇毅都不禁感到有些太過龐大了，不過現在蘇毅只是48師獨立團的團長，而且48師獨立團還是暫編的，蘇毅現在也只能多組建一些營級單位。
擔任48師獨立團各個營營長的人，都是跟隨蘇毅從新集鎮殺出來的原獨立團軍官，而各營下面那些連長，則有很大一部分是由起義的人類士兵和被俘的大秦陸軍軍官來擔任的。
為了盡快把新的48師獨立團武裝起來，蘇毅從進入鳳凰山山區的夜里，到十二日的中午，一直都沒有休息，把大量的武器裝備和各種物資，通過星際之門搬運到了大秦國這邊的世界，使得48師獨立團在完成新的整編之時，四萬七千余名獨立團的官兵也全部配備了武器，甚至可以說這四萬七千余名獨立團的官兵已經武裝到了牙齒。
48師獨立團的每個步兵營，下設八個步兵連、一個防空連、一個炮兵連和一個營部，每個連都在一百三十人以上。
步兵連的士兵大部分都配備了95式自動步槍和92式手槍，另外每個步兵連還配備有十六挺89式重機槍、十支88式狙擊步槍和十具單兵反坦克導彈。
防空連配備有十二挺勃朗寧M2高射機槍、十二門厄利孔20毫米四聯防空炮和二十具單兵防空導彈。
炮兵連配備有十二門57毫米戰防炮、二十四門60毫米迫擊炮和十二門100毫米迫擊炮。
48師獨立團的偵察營和警衛營，只裝備了少量的重機槍和迫擊炮，裝備了更多的狙擊步槍、單兵反坦克導彈和單兵防空導彈，按照蘇毅的想法，偵察營和警衛營主要是執行特種作戰以及在關鍵時刻充當突擊隊。
48師獨立團的防空營，裝備了更多的防空炮和單兵防空導彈，其中還有博福斯40毫米雙聯防空炮和88毫米FLAK高射炮。
48師獨立團的炮兵營，則主要裝備有M1897式75毫米野炮和M2式105毫米榴彈炮，這兩種火炮在拆卸成零件之后，已經可以通過星際之門，被蘇毅搬運到大秦國這邊的世界。
48師獨立團的每個炮兵營，裝備有一百零八門M1897式75毫米野炮、五十四門M2式105毫米榴彈炮和一百零八門100毫米迫擊炮。