但最終為什么又反出東林而加入了閹黨，成為閹黨打擊東林黨急先鋒呢？
原來事出天啟四年，當時吏科都給事中出缺，左光斗通知阮大鋮來京遞補。
然而善于內斗的趙南星、高攀龍、楊漣等一伙人，因為與左光斗發生內訌，因此“以察典近，大鋮不可用”，而準備改用高攀龍的另一名弟子——同為東林闖將的魏大中。等到阮大鋮至北京時，趙南星一伙人使之補工科。
吏居第一，而工居最末。本來按資歷遞補應該輪到吏科的阮大鋮，但這樣的結局，不但對阮大鉞不公，更是對他的羞辱。
就是嗎，在家的慶功宴都擺好了，連雞都燉了，結果這事黃了，阮大鉞回家怎么和親朋交代？
此時魏忠賢出現了，他讓阮大鋮遂得償心愿。但是，阮大鋮的官沒能做多久，東林的可怕壓力，就讓他上任未及一月便棄官逃回老家。從此大鋮與東林決裂。
然而魏黨事敗，他又書指出東林與閹黨都“黨附宦官”，應該一起罷去的奏章。但是，這個家伙是個十足的投機客，當時他寫了兩本內容截然相反的奏折。一個是攻擊閹黨，證明自己說東林黨；一本是攻擊東林，證明自己是閹黨的，堵風向。
將這兩本奏折一起送至北京的朋友楊維垣處。
但楊維垣因為正和東林敵對，因此沒有按照他的囑托“見機行事”，而專門上了第二本。然后楊維桓得以憑借阮大鉞的奏折上京任了光祿卿，結果阮大鉞白忙活一場，弄了個替人作嫁衣裳。
這算是被朋友踩了一腳。結果他名列逆案被罷官，避居安慶、南京，招納游俠，談兵說劍，結成文社。
中途他想與復社和東林講和，因此在復社領袖張溥，為其師周延儒鳴冤而奔走活動時，慷慨解囊相助，表示愿意重歸東林。東林反對復社報答他，結果他的目的沒有達到。
但也正因為此，他開始堅定的反對東林了。
“人品是差了點。”趙興點頭。
崇禎驚訝？“還差了點？差大發了。朕就沒有看過這樣厚顏無恥的小人。”然后苦笑：“你這個人啊，有時候將人看到過好了。歷朝文人中不缺小人，歷代文臣中不缺奸臣，唐有宋之問，宋有蔡京，前朝有嚴嵩，但將這小人做得這樣徹底，文采如此出眾者鮮。我們只能感嘆上天是如何將這劣性和才情，統一在阮大鋮一人之身了。”
趙興淡淡一笑：“我們要他也不是為了治國，用他的目的，就是為了和東林復社撕咬，這活就不是人品方正的人能干的。還就得這種極品小人才能行。”然后語重心長的勸崇禎：“我們要因才任用，不能埋沒任何人的優點啊。小人，也是優點啊。”
崇禎一口茶水，伴著一口老血噴出。
最終還是趙興說服了崇禎，同意恢復他官職，讓他掛職禮部侍郎，御史，協管詹士府事。也就是說，給他這個小人懟人，以充分的方便。