1940年10月，由于非法進入印度支那事件，他代替富永恭次任參謀本部第1部長，強硬主張對美英開戰，還和主張慎重的軍務局長武藤章打了一架。1941年10月，晉升為陸軍中將。在后來的瓜達卡納爾戰役中，由于島上部隊補給斷絕，在民用艦船的征調問題上，在1942年12月5日和軍務局長佐藤賢了鬧翻，由于首相兼陸軍大臣東條英機認為保有一定程度的民間船舶擴大軍需生產比給前線補給更重要，他沖到首相辦公室當面大罵東條英機是混賬，結果被關了15天禁閉，后調任到南方軍總司令部工作，從此遠離陸軍的權力中心。
1943年3月接替牟田口廉也任第十八師團師團長，當時升任15軍司令官的牟田口打算打進印度，但參謀長小畑信良少將說補給不允許，結果田中親自一在4月的作戰會議上鼓動牟田口拿出司令的權威，撤了膽小的參謀長的職務。
田中新一中將前幾天讓參謀長瀨尾少將主持師團部工作，親自趕到密支那來，主持消滅英軍傘兵部隊工作。
田中新一中將把在孟拱的第56聯隊長佐藤又三郎大佐，在密支那的步兵第114聯隊長大冢宏大佐和密支那城防司令水上源藏少將召集在一起開會，研究部署消滅英軍辦法。
水上源藏少將說：“我們為什么不立即把英軍消滅了？一直拖，我好擔心會夜長夢多。現在又有一支空降隊伍降落在了枯門嶺，您又不讓我派兵圍剿，您能把想法再跟我們說說清楚嗎？”
田中新一中將笑說：“這次跳傘空降的是中國軍隊，代號0007，1000人不到，你想中國軍隊的戰斗力能強大到哪去？我重申，不立即把英軍消滅了的原因是，吸引美國特種兵麥支隊前來救援，美國特種兵有數千人，象老鼠一樣鉆在密林里，我們找不到，沒法消滅。我想通過圍困英軍，引誘美軍從密林里走出來，從而一舉把其消滅了。這次跳傘空降在枯門嶺的中國軍隊，其任務極有可能就是救援英軍。既然中國軍隊會前來救援英軍，我們何必興師動眾，穿越叢林前往圍剿？吸引不來美軍，能把中國救援軍隊消滅了也不錯嘛！”
就在這時，作戰參謀匆忙跑來，把一份電報遞田中新一中將，田中新一中將看后，趕緊看向新平洋方向。水上源藏少將接過電報一看，嚇了一大跳，也趕緊看向新平洋方向。
水上源藏少將說：“司令官閣下，中國的新1軍怎么會突然變得如此強大？我好擔心新平洋會守不住。”
田中新一中將嘆氣說：“中國新1軍向新平洋發動進攻行動的目的，是為了策應跳傘中國軍隊救援英軍。看來中國跳傘軍隊很快就會走出枯門嶺，前往圍困英軍處救援。我們不能亂了陣腳，被中國駐印軍牽著鼻子走，要有戰略定力。你把主要精力仍然放在圍困英軍，從而消滅救援中國跳傘軍隊方面。我們在新平洋方向的戰略安排是層層阻擊，逐次消耗中美聯軍，那個方向不是決戰點，即使失去，也在我們的戰略安排之中。我們和中美聯軍的決戰點在孟拱，屆時絕對不能有中美英特種部隊襲擾，影響我們的戰略安排。”
水上源藏少將想了想后，恍然大悟說：“司令官閣下高見！我想我軍在新平洋堅守一個月應該不成問題。接下來，我們一起研究如何消滅中國跳傘隊伍吧！”
田中新一中將點頭說：“很好！你終于想明白了。我想讓第56聯隊和114聯隊各抽調一個大隊，在被圍英軍西北側設下埋伏，中國代號為0007傘兵部隊只要敢來救援，就把之堅決消滅了。”
密支那城防司令水上源藏少將、步兵第56聯隊長佐藤又三郎大佐和步兵第114聯隊長大冢宏大佐齊聲說嗨。