白石義城已經脫離了火之國的束縛，再也不是大名能夠左右的人物了。
讓他國部隊進入火之國圍攻木葉，這種事出現一次已經讓大名飽受非議，再有第二次，火之國民眾就該懷疑大名是不是傻子又或者已經被人控制。
猿飛日斬看穿了這一點，所以才如此肆無忌憚。
講真的，波風水門跟猿飛日斬的政治手段比起來，簡直就是弟中弟。
所以大名現在的確拿猿飛日斬沒有辦法，甚至連削減經費都做不到，因為木葉會撂挑子不干，一個忍者都不為他培養。
這事已經發生過一次。
學院的學生只有文化課老師，忍術課老師全部罷工。
然而大名又不想被猿飛日斬拿捏，思來想去，突然開始把木葉城的民眾大規模遷移出去，準備另建一個學院。
木葉只派一些中忍來上課，大名手底下又不是沒有中忍，你不想為我培養忍者，那也別想從我手里拿一分錢！
一見到這種情況，猿飛日斬立刻慫了，最終雙方經過一次又一次的會談，重新商定了學院的運營模式。
原有的運營模式不變，但是猿飛日斬的院長權限不僅僅只在學院內部生效，整個木葉城都要受他管控，而大名只得到了一些A級忍術傳承。
這種事情從近處看，猿飛日斬是勝利者，但是從長遠看，大名卻有了打破忍術傳承被壟斷的資格。
A級忍術只要悉心研究，總會有些天賦異稟的忍者把他們變成禁術。
雙方商談結束后，木葉學院直接推倒了隔離圍墻，同時開始派忍者控制木葉城。
大名的忍者悉數撤出木葉城，回歸都城護衛大名。
為了權力和大名再次鬧翻，這里面的得失就見仁見智了。
總之大名開始縮減木葉經費，省下來的錢在都城自己培養忍者。
至于猿飛日斬，他開始嘗試著不依靠大名，自己發展城市培養忍者，倒也像模像樣。
木葉現在擁有五十多萬居民，忍者經過這幾年的休養生息卻只有數千人，但是可以預見，木葉再次輝煌的日子不遠了。
雖然還掛著學院的名稱，但實際上木葉再一次恢復了忍村的制度。
如果不是顧忌白石義城，猿飛日斬都要恢復火影的制度。
期間他嘗試過推到白石義城的雕像，結果白石義城發了狠，直接來了個四赤陽陣，雙方再次硬耗了一個月，事情無疾而終。
木葉學院名存實亡。
與此同時，宇智波的問題再一次擺在猿飛日斬面前。
白石義城圍攻木葉，九尾襲擊木葉，宇智波一方面表現的太過積極，另一方面跟大名和白石義城的關系有些不正常，還有宇智波斑，雖然猿飛日斬不相信那個面具男人就是宇智波斑，但他的寫輪眼卻不是假的。
種種因素加起來，木葉高層對于宇智波的猜忌越發嚴重，排斥孤立，團藏還在暗中肆無忌憚殺害宇智波外出執行任務的忍者。
雙方的矛盾沖突日益嚴重。