現在有了原南京水師的加入，李彥直有絕對的信心，能夠擋住反賊水師，甚至把他們消滅在南京城外江中也不是不可能。
原先自己的部下只有20余艘海船，沒有普通的江船護衛，所以才給了反賊水師火船機會，現在有了南京水師加入，那么就有了足夠的護衛，再不用怕敵軍放火船來攻！
當然，劉孔昭手下的水師實力并不怎么樣？只有200來艘江船，兵冊上士兵數量有三萬之多，實際還不到一萬人，不過也足夠了！
“總督大人，您要是早把水師交給我就好了。”臨走時，李彥直還是忍不住對洪承疇道。
要是半個多月前就把水師交給自己，自己就有足夠的時間整頓磨合，而現在，反賊大軍即將兵臨城下，留給自己整頓損失的時間實在不多了，所以對洪承疇的優柔寡斷，李彥直有些不滿。
洪承疇只能苦笑。
這世上的事情根本就沒有那么簡單，南京城的情形尤其復雜。直到現在，用了這么時間，花費了這么大功夫，洪承疇才算把南京城內稍微理順。算是掌握了南京的倉儲，掌握了水師，并且把南京城24衛兵權也掌握在了自己手里，不到一個月的時間能取得這么大的效果，已經是很難得了。
洪承疇剛到南京城時，等待他的并不是熱烈歡迎，而是整個南京城的敵意。南京城六部尚書，幾十位勛貴以及整個南京城的士紳對他的到來都非常的冷淡。
洪承疇現在還記得，當他到達南京城外的時候，迎接他的只有寥寥幾位官員。南京城的頭面人物大都沒有出現，要知道他現在的身份，可是兵部尚書，可是皇帝親自任命的江南總督啊！
對當時的洪承疇來說，這是深深的羞辱，可是為了抵抗反賊的進攻，為了皇帝交給他的重擔，洪承疇把這些羞辱都默默地吞了下去。
接下來的時間，洪承疇做了很多努力，但是整個官場都對他非常的不配合。
要想守城，無非是錢糧兵三事。
錢糧南京城有專門的倉儲總督，負責掌管南京城41衛倉，總管著整個南京城的錢糧。而現在的南京總倉儲是南京戶部左侍郎張庭登，對洪承疇要掌管南京倉儲的做法，張庭登表面上表示全部配合，暗地里卻是陰奉陽違。
不僅是張庭登，便是普通的庫大使，各個倉庫的小吏們都不配合。當洪承疇派人去查賬的時候，很多庫大使不是請假不在，就是倉庫的帳薄突然失火被燒掉，而倉庫的官吏都不知所蹤。足足用了十天的時間，41個衛倉還沒有查清一半。
沒有錢糧怎么能夠守住南京城，洪承疇大怒，再也不客氣，以江南總督的身份下令徹查41衛倉，并派遣手下的軍隊強行接管了41個倉庫，把原本的官吏全部驅逐。
而他的這種行為，卻惹惱了整個南京官場，南京六部的官員，南京督察院的御史們紛紛上書叫囂，彈劾袁崇煥越權。對這些彈劾，洪承疇自然不在意，但是他從此也感到了整個南京官場對自己的敵意，以及對皇帝的怨怒！
掌管錢糧的事情總算解決了，但是掌管南京軍隊卻頗為麻煩，因為整個南京的軍隊向來都是由勛貴們掌控。南京城的勛貴在南京軍隊中的滲透非常的嚴重，可以說，整個衛軍中級以上的軍官全部都是由勛貴子弟擔任，或者和勛貴們有著千絲萬縷的聯系。
整個南京城兵冊上的軍隊有15萬之多，實際的軍隊只有兩萬人，而且都是老弱病殘，且握在勛貴的手中，對此，洪承疇也是無可奈何，除非他把這整個南京軍隊徹底的清理，但是那可能嗎？勛貴們肯定不愿意，如果他強行插手軍隊的話，那么等待的將會是士兵們的嘩變，這是非常有可能，或者說是肯定會發生的。