李彥直的水寨就在秦淮河入長江處，龍江船廠所在碼頭處，也是原來操江水師營寨所在。
二十余艘海船實在太大，現有的碼頭根本不足用，沒奈何只能停泊在江心。
在龍江船廠以南，設有水師炮臺，其中火炮二十多門，用以封鎖江心洲以東的江面。
身為總管所有水師的總兵，李彥直并未呆在水寨，而是把最大的蓋倫船當做了指揮座艦，整日都呆在船上處理各種軍務。
對李彥直來說，手中這二十艘海船才是根本，原本的操江水師只是輔佐。
如意伯劉孔昭去鎮江了，把操江水師整個留給了李彥直。而操江水師和南京其他軍隊一樣，情況也非常復雜，勛貴們滲透很厲害，軍中很多軍官都和勛貴們有著這樣那樣的聯系。
統領這樣的水師和反賊作戰，李彥直自然不放心，說不定什么時候，這些水師軍官便會倒戈。然而他也沒有充足的時間對整個軍隊進行清洗。
這種情況下，之后能采用斷然手段了。
洪承疇決定對勛貴動手之前自然知會了李彥直，李彥直便以軍議為名召集所有把總以上軍官議事，然后把這些軍官都軟禁在自己的坐船上。
當然李彥直做的也沒有那么生硬，并沒有直接殺人，而是以成立參謀團的名義，把很多軍官留下來作為參謀，而挑選了劉孔昭一系的軍官回去帶兵。
劉孔昭走的時候，并未帶走多少人，其家丁親信都留了下來，這些人是劉孔昭的嫡系，自然可以放心使用。
“爾等也不用擔心，本帥也不會拿你們怎么樣，只不過大敵當前，需要整編軍隊統一指揮，只能暫時委屈大家了。不過本帥會給大家出戰的機會，只要諸位能奮勇殺敵立下戰功，本帥可以保證事后諸位官職仍然保持不變。”李彥直對這些被扣留的軍官道。
這些軍官面面相覷，有的非常不滿，有的更是非常惱怒，有的很恐懼，但都無可奈何。這船上都是禁衛軍，他們被解除了武裝，便是想作亂也沒有成功的可能。城中七家勛貴被抄家的消息已經從李彥直口中得知，更是讓和那七家勛貴有瓜葛的軍官膽戰心驚，生怕李彥直會對他們下手。
李彥直自然不會胡亂殺人，此時他全部的心思都放在數十里外的反賊水師動靜上。
“大帥，反賊水師在三十里外萬安灘扎下大營，并未有向我水寨進攻的意圖。”哨船回來了，帶回了反賊水師的消息。
“可惜我們是逆流船速太慢，要不然可以徑自前往進攻他們，阻止他們立營扎寨。”張煌言道。
“反賊水師距離咱們這么遠立寨，就是在防咱們進攻。”李彥直淡淡道。
“總帥，這一仗咱們該怎么打？”張煌言問道。
李彥直默了默：“洪總督給我的任務是守住長江水道，保證南京城物質運送的暢通，若是按照洪總督的意思，咱們只需要守住長江水道便可。”
張煌言點點頭：“那咱們便守在這里。咱們這里有水寨，有炮臺，再加上咱們船隊的火力，足以封鎖住長江。”
李彥直搖了搖頭：“可是我不想就這樣被動防守！洪總督身邊只有四千禁衛軍，卻要守住諾大的南京城，咱們手中有二十艘海船，船上有上百門紅夷大炮，有禁衛水師士兵七千人，再加上一萬多操江水師輔助，豈能就這樣干等下去？”
“那就打，先擊敗反賊水師，再抽調軍隊幫助洪總督守城！”張煌言握拳道。
將帥意見統一，李彥直當即寫了一封請戰信，命人送到南京城內總督府。