時間一天天的過去，ZAFT的降下作戰成功，在卡潘塔利亞建立起了屬于自己的基地，更將無數的中子干擾器打進了地球之中，讓高度依賴核能的地球在第一時間就陷入到了能源匱乏的狀況之中。
能源的匱乏帶來的影響席卷全球，聯合方面更是因此而損失慘重，在ZAFT的進攻中開始進入劣勢。
反倒是那些親PLANT國家，或許是因為雷蒙的意見起到了作用，ZAFT方面在使用中子干擾器的同期也將大批的物資降下地球，一定程度遲緩了那些親PLANT國家因為能源匱乏而帶來的一系列問題。
同樣也因為ZAFT在對聯合的作戰中大成功的關系，從聯合手中掠奪到的大筆物資也成為了能夠拿出來的巨大收獲，像是一桿旗幟一樣立在了那些親PLANT國家的前面，第一個跳出來開始出兵協助ZAFT的，便是地球上另一個整體大洋洲聯邦。
世界從此開始有了區分兩極的預兆，那些得到幫助的親PLANT國家得到了實惠，反饋的聲音也逐漸變小，而那些堅定站在聯合一方的人或是勢力，則是掀起了更大的反調整者反PLANT浪潮。
隨后為了反擊，聯合方面再次集結了兩個艦隊做好了充足的準備開始從月球基地出發，以PLANT的資源衛星為跳板又一次超PLANT發起了進攻。
雙方在資源衛星發生激戰，可因為軍事裝備的落后，聯合方面的兩個艦隊最終只能倉惶撤退，而因為這次的作戰，PLANT方面決定將資源衛星徹底改造成宇宙要塞，以此來加強對PLANT的防衛能力。
之后，ZAFT也開始在地球進行了大規模的軍事行動，地中海作戰和聯合軍的海上艦隊發生交戰。
蘇伊士運河作戰，ZAFT方的吉恩面對聯合方面龐大的地面戰車力量也陷入了苦戰之中，在地面作戰中吉恩的缺點得以完全暴露，行動笨拙，速度不夠，攻擊距離太短，突進能力太差，直至新型機體地面用四足MS巴庫的登場才逐漸的改變劣勢。
在這地面的作戰之中，沒有了沙漠之虎的安德魯卻也涌現出了集體的力量，付出了更多的東西最終還是成功的完成了作戰。
之后便是月面爭奪戰，聯合方面在最后關頭使用了獨眼巨人系統，原本是運用于礦業方面的系統，但在經過改造調整之后成了一種堪比核彈，甚至比起核彈還要恐怖的自爆型武器，ZAFT方面受到了巨大的損失，即便是聯合也出現了數量恐怖的犧牲。
因為這次的事件，雙方的仇恨也再次升級回歸到了原本的道路上，為了PLANT，為了調整者，為了清凈而未來的天空，為了自然人，這樣的口號已經變成了雙邊的主流。
而在這次事件中，帕特里克的威望受到了打擊，反倒是在作戰會議中提到圍點打援，不強行拿下聯合軍月面基地的雷蒙也被越來越多ZAFT的人所熟知。