設立交趾承宣布政使司、廣南承宣布政使司、中南承宣布政使司和東南承宣布政使司之后，這南洋基本是劃入大明朝廷管理范圍之內了，但是，還有一些問題需要解決。
比如，被俘虜和已投誠的東吁軍、暹羅軍、安南軍和占城軍，其中東吁王朝大軍足有三十余萬，暹羅軍和安南軍也分別有十余萬和二十余萬，如果按以往的作法，這些軍隊要么就地解散，要么先押去干幾年勞役再解散，但是南洋這情況卻不能這么辦。
這南洋可沒有大明本土那么安全，周邊還有很多其他國家呢，如果沒有一點兵力防守，人家跑來進攻怎么辦？
難道還從大明本土調大軍過來守衛南洋各地嗎？
這顯然是不現實的，大明現在留下的精銳之師就那么多，連京城附近都沒什么軍隊駐守了，還調大軍來駐守南洋各地，豈不荒唐。
所以，這南洋必須保留一定的兵力以防止周邊各國進犯，而且，必要的時候還可以帶著他們去開疆擴土。
張斌考慮了一陣，還是決定保留十五萬常備軍，分別駐守廣南、東南和中南三個承宣布政使司，當然，這常備軍就不能按原來的編制由東吁軍、暹羅軍，又或是安南軍縮減而成了，這樣反而會造成隱患，張斌采取的是混編，也就是從東吁軍、暹羅軍、安南軍和占城軍中選拔出十五萬青壯，混編成廣南軍、東南軍和中南軍分別駐守三個承宣布政使司。
南洋地域的駐防張斌全部交給了遼陽侯盧象升，選拔青壯和混編成軍的事他也全部交給了盧象升，而廣南軍、東南軍和中南軍中千總、把總以上的將領則全部提拔天雄軍基層軍官擔任。
這盧象升是緊鑼密鼓的開始整編南洋諸國的軍隊了，而張斌的目光卻投向了南洋承宣布政使司，這會兒南洋承宣布政使司僅有新港和舊港兩府，其他諸如滿加次、渤泥、蘇祿等地域他還根本沒有去管呢，還有呂宋，這會兒還在西班牙手里呢。
現在，大明要收復呂宋自然是很簡單的事情，張斌只要率福廣水師艦隊過去，分分鐘都能打的科奎拉舉手投降，但他不能這么干，因為西班牙這會兒是大明的盟國。
那么，怎么辦呢，整個南洋就留著這么個地方沒有劃入大明治下，總讓人感覺那么膈應，而且萬一以后西班牙跟大明翻臉了，這可是個巨大的隱患。
張斌對著地圖仔細研究了半天，最后決定，用科羅曼海岸和西班牙換，反正科羅曼海岸是白撿來的，這會兒大明也沒有開發，而西班牙在呂宋也沒有獲得什么利益，相信他們不會為了這么點小事而拒絕大明，要知道，現在他們能不能翻盤還要看大明的臉色呢。
定下策略之后，張斌便開始率福建水師艦隊，帶著秦軍和福廣軍，沿著南洋諸島巡視了一圈，大明王師所到之處滿加次、渤泥、蘇祿等紛紛臣服，科奎拉也滿口答應勸他們國王陛下跟大明置換呂宋殖民地，南洋承宣布政使司又多了滿加次、渤泥、蘇祿和呂宋四府，至此，整個南洋才算是完全掌控在了大明手中。