十一年春正月壬戌，敕嚴邊備。閏二月甲子，俺答子乞慶哈襲封順義王。緬甸寇永昌。乙丑，如天壽山謁九陵，免所過田租。庚午，如西山謁恭讓章皇后、景皇帝陵。辛未，還宮。乙酉，振臨、鞏、平、延、慶五府旱災，免田租。三月甲申，追奪張居正官階。庚子，賜硃國祚等進士及第、出身有差。夏四月丁巳，張四維以憂去。己未，吏部侍郎許國為禮部尚書兼東閣大學士，預機務。甲戌，承天大雨，江溢。是月，廣東羅定兵變。五月，我大清太祖高皇帝起兵征尼堪外蘭，克圖倫城。六月乙丑，振承天、漢陽、鄖陽、襄陽災。秋八月丙辰，免山西被災稅糧。九月甲申，如天壽山謁陵。己丑，還宮。冬十月癸亥，停刑。辛未，河南水災，蠲振有差。十一月己卯朔，日有食之。十二月庚午，慈寧宮災，敕修省。是年，琉球入貢。
十二年春二月丁卯，京師地震。己巳，釋建文諸臣外親謫戍者后裔。三月己亥，減江西燒造瓷器。夏四月乙卯，籍張居正家。丁巳，游擊將軍劉綎討平隴川賊。五月甲午，京師地震。六月辛亥，以云南用兵，免稅糧及逋賦。秋八月丙辰，榜張居正罪于天下，家屬戍邊。九月丙戌，奉兩宮皇太后如天壽山謁陵。己丑，作壽宮。辛卯，還宮。冬十月丁巳，停刑。丙寅，免湖廣、山東被災稅糧。十一月己丑，余有丁卒。十二月甲辰，前禮部侍郎王錫爵為禮部尚書兼文淵閣大學士，吏部侍郎王家屏兼東閣大學士，預機務。癸亥，罷開銀礦。是年，安南、烏斯藏入貢。
十三年春正月辛卯，四川建武所兵變，擊傷總兵沈思學。二月丁未，南京地震。京師自去年八月不雨，至于是月。庚午，大雩。三月甲申，大雩。己丑，李成梁出塞襲把兔兒炒花，大破之。壬辰，減杭州織造及尚衣監料銀。尚寶司少卿徐貞明督治京畿水田。夏四月丙午，大雩。戊申，以旱詔中外理冤抑，釋鳳陽輕犯及禁錮年久罪宗。戊午，步禱于南郊，面諭大學士等曰：「天旱雖由朕不德，亦天下有司貪婪，剝害小民，以致上干天和，今后宜慎選有司。」蠲天下被災田租一年。五月丙戌，雨。六月辛丑，慈寧宮成。壬寅，建武所亂卒伏誅。是月，四川松、茂番作亂。秋八月己酉，京師地震。閏九月戊戌，振淮、鳳災。癸卯，如天壽山閱壽宮。戊申，還宮。庚申，停刑。冬十二月丁卯，汰惜薪司內官冗員。是月，順義王乞慶哈卒。是年，土魯番、烏斯藏入貢。
十四年春二月癸未，嚴外官饋遺。三月戊戌，以旱霾，諭廷臣陳時政。癸卯，禁部曹言事，罷治京畿水田。癸丑，賜唐文獻等進士及第、出身有差。戊午，久旱，敕修省。夏四月癸酉，京師地震。六月癸未，松茂番平。是夏，振直隸、河南、陜西及廣西潯、柳、平樂，廣東瓊山等十二縣饑。山西盜起。秋七月癸卯，振江西災。戊申，敕戶、兵二部撫安災民，嚴保甲。是月，淇縣賊王安聚眾流劫，尋剿平之。九月壬辰，王家屏以憂去。乙卯，停刑。己未，發帑遣使振河南、山東、直隸、陜西、遼東、淮、鳳災。冬十月丙寅，禮部主事盧洪春以疏請謹疾，杖闕下，削籍。十一月癸卯，祀天于南郊。是年，土魯番入貢。
十五年春正月壬辰，發帑振山西、陜西、河南、山東諸宗室。三月乙卯，乞慶哈子撦力克襲封順義王。夏四月，京師旱，大疫。六月戊辰，禁廷臣奢僭。是月，京師大雨。振恤貧民。秋七月，江北蝗，江南大水，山西、陜西、河南、山東旱，河決開封，蠲振有差。八月庚申，以災沴頻仍，敕撫、按官懲貪吏，理冤獄，蠲租、振恤。九月丁亥朔，日當食，陰云不見。己丑，停刑。冬十月庚申，大學士申時行請發留中章奏。十一月戊子，鄖陽兵噪，巡撫都御史李材罷。是年，哈密、琉球、烏斯藏入貢。
十六年春三月壬辰，詔改《景皇帝實錄》，去郕戾王號，不果行。山西、陜西、河南及南畿、浙江并大饑疫。夏四月，振江北、大名、開封諸府饑。五月，四川建昌番作亂，討平之。乙巳，以軍儲倉火及各省災傷，敕內外官修省。六月庚申，京師地震。甲子，以災傷停減蘇、杭織造。秋七月乙卯，免山東被災夏稅。庚午，定邊臣考績法。八月乙未，詔取太倉銀二十萬充閱陵賞費。九月己未，停刑。庚申，如天壽山閱壽宮。甲子，次石景山觀渾河。乙丑，還宮。庚午，甘肅兵變，巡撫都御史曹子登罷。是月，青海部長他不囊犯西寧，殺副將李魁。冬十一月辛酉，禁章奏浮冗。是年，烏斯藏入貢。