夏四月癸未，振遼東饑。辛巳，倭分犯浙江、福建。秋八月己未，吉能犯永昌、涼州，圍甘州。冬十月癸丑，禮部進瑞芝一千八百六十本，詔廣求徑尺以上者。
十一月丁亥，諭法司恤刑。是年，琉球、暹羅入貢。
三十八年春二月庚午，把都兒犯潘家口，渡灤河，逼三屯營。三月己卯，掠遷安、薊州、玉田。庚寅，賜丁士美等進士及第、出身有差。癸巳，倭犯浙東，海道副使譚綸敗之。甲午，逮浙江總兵官俞大猷。夏四月丁未，倭犯通州。甲寅，倭攻福州。庚申，倭攻淮安，巡撫鳳陽都御史李遂敗之于姚家蕩，倭退據廟灣。
丙寅，副使劉景韶大破倭于印莊。五月辛巳，逮總督薊遼右都御史王忬下獄。
甲午，劉景韶破倭于廟灣，江北倭平。六月乙巳，辛愛犯大同。秋八月己未，李遂、胡宗憲破倭于劉家莊。甲子，振遼東饑，給牛種。是月，俺答犯土木，游擊董國忠等戰死。九月，犯宣府。是年，土魯番、天方、撒馬兒罕、魯迷、哈密、暹羅入貢。
三十九年春正月丙戌，俺答犯宣府。二月丁巳，南京振武營兵變，殺總督糧儲侍郎黃懋官。戊午，振順天、永平饑。倭犯潮州。三月癸未，大同總兵官劉漢襲敗兀慎于灰河。丁亥，打來孫犯廣寧，陷中前所。殺守備武守爵、黃廷勛。夏五月壬午，振山西三關饑。壬辰，盜入廣東博羅縣，殺知縣舒顓。秋七月乙丑朔，把都兒犯薊西，游擊胡鎮御卻之。庚午，劉漢襲俺答于豐州，破之。九月己巳，俺答犯朔州、廣武。冬十二月，土蠻犯海州東勝堡。是月，閩、廣賊犯江西。是年，免畿內、山西、山東、湖廣、陜西被災稅糧。暹羅入貢。
四十年春二月辛卯朔，日當食，不見。振山東饑。丁未，景王之國。三月壬戌，振京師饑。夏四月丁未，振山西饑。五月乙亥，李本以憂去。閏月丙辰，賊犯泰和，殺副使汪一中、指揮王應鵬。秋七月己丑朔，日有食之。庚戌，俺答犯宣府，副總兵馬芳御卻之。九月庚子，犯居庸關，參將胡鎮御卻之。辛丑，振南畿災。冬十一月甲午，禮部尚書袁煒為戶部尚書兼武英殿大學士，預機務。庚戌，吉能犯寧夏，進逼固原，辛亥，萬壽宮災。十二月丙寅，把都兒犯遼東蓋州。是年，烏斯藏入貢。
四十一年春三月辛卯，白兔生子，禮部請告廟，許之，群臣表賀。壬寅，賜申時行等進士及第、出身有差。己酉，重作萬壽宮成。夏五月壬寅，嚴嵩罷。壬子，土蠻攻湯站堡，副總兵黑春力戰死。秋九月壬午，三殿成，改奉天曰皇極，華蓋曰中極，謹身曰建極。冬十月，免南畿、江西被災稅糧。十一月乙酉，分遣御史訪求方士、法書。丁亥，逮胡宗憲，尋釋之。辛丑，吉能犯寧夏，副總兵王勛戰死。己酉，倭陷興化。是月，延綏總兵官趙岢分部出塞襲寇，敗之。免陜西、湖廣被災及福建被寇者稅糧。是年，琉球入貢。
四十二年春正月戊申，俺答犯宣府，南掠隆慶。夏四月庚申，倭犯福清，總兵官劉顯、俞大猷合兵殲之。丁卯，副總兵戚繼光破倭于平海衛。秋八月乙亥，總兵官楊照襲寇于廣寧塞外，力戰死。冬十月丁卯，辛愛、把都兒破墻子嶺入寇，京師戒嚴，詔諸鎮兵入援。戊辰，掠順義、三河，總兵官孫臏敗死。乙亥，大同總兵官姜應熊御寇密云，敗之。十一月丁丑，京師解嚴。是年，琉球入貢。