但是問題是，資源豐富的潘朵拉星球并不適合人類生活，這里的空氣對人類致命，本土的動植物都是兇猛的掠食者，極度危險。
這里的環境也造就了與人類不同的種族：10英尺高（約3米）的藍色類人生物娜美族。娜美族不滿人類拓荒者的到來，也不喜歡人類的機器在這個星球的土地上因為到處挖礦而留下的斑斑傷痕。
雖然潘多拉星球環境嚴酷，但人類只要帶上空氣過濾面罩，甚至可以裸露皮膚在潘多拉星球上作業。但是由于人類即使學會納威語也無法和納威人直接交流，于是科學家們轉向了克隆技術：他們將人類DNA和娜美人的DNA結合在一起，制造了一個克隆娜美人，這個克隆娜美人可以讓人類的意識進駐其中，成為人類在這個星球上自由活動的化身。然而并不是任何人都可以操縱這個克隆娜美人，只有DNA與他身上人類DNA配型相符的人才有這樣的能力。杰克·薩利的雙胞胎哥哥是這個克隆Na'vi的人類DNA捐獻者，他就可以操縱這個克隆娜美人，然而他被殺死了，采礦的公司為了不讓砸下去的錢白砸，必須找到一個可以代替他操縱克隆Na'vi的人，這個人的DNA還必須和其配型相符，于是他們自然就找到了杰克·薩利，杰克·薩利對此很高興，因為那意味著他又能走路了。
幾年后，杰克·薩利到了潘多拉星球，他發現這里的美景簡直無法用語言來形容，高達900英尺的參天巨樹、星羅棋布飄浮在空中的群山、色彩斑斕充滿奇特植物的茂密雨林、晚上各種動植物還會發出光。就如同夢中的奇幻花園。不過很快他就體驗到了這里的危險，一頭閃雷獸與他狹路相逢，在逃命過程中杰克與隊友失去了聯系，在晚上的時候又被一群土狼襲擊，杰克奮起戰斗，在整個戰斗的過程中杰克寡不敵眾危在旦夕，危急關頭中一支箭射死了毒狼，杰克得救了。救他的是娜美族的公主，杰克從她口中了解到了更多潘多拉星球的知識。
娜美族人一直以來都與潘多拉星球的其他物種和諧相處，過著一種簡樸天然的生活，杰克在和這個Na'vi女孩的相處過程中逐漸轉變了對人類來這里采礦的看法，他意識到已經找到值得為之戰斗的東西了。不過杰克·薩利如果要加入娜美族人對抗人類入侵者的戰爭，要付出很大的代價：他不能永遠呆在化身中，當化身——克隆娜美人睡覺時，他就會回到自己半身不遂的人類身體中，只有通過專門的連接設備才能重新回到化身中。一旦與自己的同胞為敵，他就失去了與化身結合的可能，只能困在殘疾的身體里，并失去那個他越來越喜歡的Na'vi女孩。
最后，人類在利益的驅動下，派遣了戰機去摧毀娜美族人所生存的家園樹，盡管杰克等人一再爭取希望可以不要那么做，但是采礦公司還是決意要去摧毀。杰克與他們協商，自己去和娜美族人交涉，讓他們離開那顆大樹，然而當他說明了一切之后，娜美族人都很憤怒，特別是杰克喜歡的那個娜美族人女孩也是很憤怒，娜美族人就把杰克和一名女教授一起捆在了刑架上了。采礦公司派遣的戰機發現他們協商失敗了。于是就下令開火，摧毀了他們前進的障礙——娜美族人賴以生存的那棵巨樹，娜美族人的領袖也被炮火炸死。
沒有了生存之地的娜美族人被迫暫居神樹之下。而杰克等人的正義行為因為和采礦公司的利益相沖，被他們關了起來。后來，他們借機駕機逃跑了，杰克騎著魅影到達了娜美族人暫居的神樹下，呼吁娜美族人作出反抗，他終于又得到娜美族人的信任。在他的呼吁下，他們聯絡了潘多拉星球上了其他民族的人，一起組建了一支幾千人的反抗軍，形成了陸空兩路的防線。采礦公司的軍隊也發現了娜美族人的反抗跡象，他們迅速裝填了大量的高烈性炸藥，準備提前消滅娜美族人。于是，娜美族人的反抗聯盟和采礦公司的軍隊展開了血戰，結果，娜美族人反抗軍最終打敗了人類，而人類的軍隊指揮也被殺死，娜美族人在杰克的幫助下，將遣送采礦公司全部離開潘多拉星球。在Na'vi的精神領袖的帶領下，娜美族人用自己的感受器與神樹相連，借助神樹的力量，將杰克·薩利的精神轉移到他的阿凡達身上，杰克最終成為了這個星上娜美人的領袖。
“剛才那個娜美女人說的哈利路亞原來是地名......”他臉色微紅的嘀咕一句，又開始查看起別的資料。
之后他知道了自己之前遇到的那種狼一樣的怪獸就叫毒狼，而那頭豹子叫閃雷獸，那些騎士的六腳馬學名重鎧馬，那些飛龍則是高山斑溪獸，霸王飛龍，魅影，蝠魟龍等多種生物，光腦中有潘朵拉星球上所有動植物的資料，他沒有細看，只是關注了一些他遇到過的。
最讓他振奮的是這個避難所外面還有一架蝎子攻擊機，官方名稱：AT-99Gunship（AT-99武裝直升機），被納美人喚作：Kunsip。
就是他剛來時候遇到的那一架飛行器殘骸。
蝎子攻擊機長11.17米，寬8.72米，高3.51米，燃料彈藥滿載最遠航距可達800公里。這種雙渦輪垂直起降旋翼機犧牲了運輸空間，卻保證了像薩姆森運輸機一般的高機動性，配備有每秒700發的50口徑火炮，還有150TK-411蜂窩火箭發射器，此外還有八枚“鷹眼地獄火”用于空對空作戰。它被RDA廣泛配備成為主要的制空力量，用于近距離空中支援和護航，“地域之門”也離不開蝎子炮艇的26小時空中守衛。
蝎子攻擊機沿用了22世紀中期的復古設計，這種久經考驗的設計能保證其在極惡劣的環境下穩定的性能，甚至駛進潘多拉星“哈利路亞山”的強磁場漩渦也依然飛行自如。不過在漩渦中飛行易導致武器系統不穩定，而且需要目視駕駛，使得蝎子攻擊機常常受到潘多拉星空中飛獸的攻擊，墜機事故也層出不窮。