隨著審判庭與灰騎士的組建，如雜草般滅之不盡的邪教組織很快就得到了遏制。
但是很快高領主議會又遇到了一個令他們無語的問題。
因為隨著原體們完成了最后的使命并陸續消失在大眾的視野中，而凡人卻需要尋找一個強大的精神寄托來撫慰自己弱小的心靈。
這也是邪教組織為何始終層出不窮的原因，但當高領主議會著手對各種邪教組織進行嚴厲的取締，找不到精神寄托的帝國民眾們漸漸在將希望寄托到了那位一直端坐在黃金王座上的人類之主，帝皇本人身上！
很快以信仰帝皇本人的各種宗教組織從各地冒了出來。
如果帝皇本人倘若還行走在人間，肯定會毫不留情的取締這些愚昧的宗教組織，哪怕這些凡人信仰崇拜的是他本人，正如當年他下令摧毀懷言者軍團的圣城一樣。
然而高領主議會卻沒有這份勇氣，哪怕這些信仰帝皇的宗教組織有違帝皇建立的帝國真理。
而隨著高領主議會的遲疑或默許，信仰帝皇似乎真的能帶來許多意想不到的好處。
比如終于找到精神寄托的民眾們干活更加賣力了，精神也不墮落了，同時也讓邪教組織失去了生長的土壤。
漸漸地帝國各地信仰帝皇的宗教組織在帝國高層的默許下如雨后春筍般的冒了出來，并逐漸有了合流的趨勢。
而這其中由以一個名為‘救世帝皇圣殿派’發展的最為迅速，其吸納的信徒中甚至出現了各地的總督乃至帝國政府的高層，然后這個宗教組織又通過政府高層打壓吞并其他信仰帝皇的組織來壯大自己。
甚至到了第31個千年的末期，這個救世帝皇圣殿派已經龐大能夠左右帝國最高權力的能力。
而這時經過一千年的漫長時光，原本高效廉潔的帝國高層因為沒有了外部壓力而早已變得腐朽墮落。
帝國官員們不再關心政務，每天只沉迷在權力游戲中。
而這些腐敗官員也希望能夠通過這個信徒眾多的民間組織來幫助他們管理無知的底層民眾，所以很快就在第32個千年的初期救世帝皇圣殿派就得到了帝國政府認可，成為了帝國政府的官方宗教，并改稱為國教教會。
而國教教會也迅速投桃報李，配合著政府施行各種政令不斷累積著政治資本，最終成功的將他們的大主教送進了十二人議會中。
而這一權力變動也宣示著帝皇一手建立的帝國真理徹底的沒落，如果帝皇還能從黃金王座站起來一定會跳腳罵娘，甚至將一枚旋風魚雷砸到這幫不肖子孫的頭上。
而更加耐人尋味的是國教的起源竟是來自那位掀起大叛亂的始作俑者，懷言者洛嘉·奧瑞利安親手編寫的《圣言錄》！
如果帝皇還能動，一定會多砸幾枚旋風魚雷到這幫不肖子孫頭上。
而現在隨著國教躋身帝國權力巔峰，帝國政府的官員們又開始了新一輪的權力游戲。
每個官員想要的都是自己權力的最大化，而一切東西甚至是帝國的軍事力量也成為了這場權力游戲中的籌碼。
甚至有人開始覺得自己的權力威信已經在黃金王座之上，整個銀河系也不過是十二人議會的掌中玩物。
而沉迷在權力游戲中帝國官員們也是整日不思進取，讓帝國的發展逐漸停滯了下來，甚至出現了文明衰退，以至于在大遠征時期的許多科技產物都成為了不可復制的‘神跡’。