人體的內環境必須與自然界這個外環境相協調、相一致，這就要求人對自然要有很強的適應性。《靈樞·五癃津液別》說:“天暑衣厚則腠理開，故汗出。……天寒則腠理閉，氣濕不行，水下留于膀胱，則為溺與氣。“這顯然是水液代謝方面對外環境的適應。人的脈象表現為春弦、夏洪、秋毛、冬石，同樣是由于人體氣血對春夏秋冬不同氣候變化所做出的適應性反應，以此達到與外環境的協調統一。如果人們違背了春生夏長秋收冬藏的養生之道，就有可能產生病變。就是一日之內、日夜之間，人體也會隨天陽之氣的盛衰而相應變化。如果違反了客觀規律，也會受到損害。
人與自然這種相參相應的關系在《黃帝內經》中是隨處可見的。無論是生理還是病理，無論是養生預防還是診斷與治療，都離不開這種理論的指導。
三、人是陰陽對立的統一體
人是陰陽對立的統一體，這在生命開始時已經決定了。具有生命力的父母之精相媾，也就是陰陽二氣相媾，形成了生命體。生命體形成之后，陰陽二氣存在于其中，互為存在的條件。相互聯系、相互資生、相互轉化，又相互斗爭。
從人體的組織結構上看，《黃帝內經》把人體看成是各個層次的陰陽對立統一體，還把每一臟、每一腑再分出陰陽，從而使每一層次，無論整體與局部、組織結構與生理功能都形成陰陽的對立統一。
四、人體是肝心脾肺腎五大系統的協調統一體
《黃帝內經》所說的五臟，實際上是指以肝心脾肺腎為核心的五大系統。
以心為例:心居胸中，為陽中之太陽，通于夏氣，主神明，主血脈，心合小腸，生血、榮色，其華在面，藏脈、舍神、開竅于舌、在志為喜。在談心的生理、病理時，至少要從以上諸方面系統地加以考慮才不至于失之片面。因此可以每一臟都是一大系統，五大系統通過經絡氣血聯系在一起，構成一個統一體。這五大系統又按五行生克制化規律相互協調、資生和抑制，在相對穩態的情況下，各系統按其固有的規律從事各種生命活動。
五、生命觀
《黃帝內經》否定超自然、超物質的神的存在，認識到生命現象來源于生命體自身的矛盾運動。認為陰陽二氣是萬物的胎始。對整個生物界，則認為天地萬物和人都是天地陰陽二氣交合的產物。陰陽二氣是永恒運動的，其基本方式就是升降出入。《黃帝內經》把精看成是構成生命體的基本物質，也是生命的原動力。在《靈樞·經脈》還描繪了胚胎生命的發展過程:“人始生，先成精，精成而腦髓生。骨為干，脈為營，筋為剛，肉為墻，皮膚堅而毛發長“。這種對生命物質屬性和胚胎發育的認識是基本正確的。
六、形神統一觀
黃帝內經》對于形體與精神的辯證統一關系做出了的說明，指出精神統一于形體，精神是由形體產生出來的生命運動。
在先秦諸子中對神以及形神關系的認識，沒有哪一家比《黃帝內經》的認識更清楚、更接近科學。關于形神必須統一、必須相得的論述頗多，如《靈樞·天年》和《素問·上古天真論》。如果形神不統一、不相得，人就得死。如《素問·湯液醪醴》和《素問·逆調論》。《黃帝內經》這種形神統一觀點對中國古代哲學有非常大的貢獻。
《黃帝內經》以五行為框架，以人體為主要研究對象，形成醫學家所特有的天人合一的思想體系。
《黃帝內經》在中國醫學有很高地位，后世歷代有所成就醫家，無不重視此書。曾被譯成日、英、德、法等文字，對世界醫學的發展也產生了不可忽視的影響。《黃帝內經》以樸素的唯物主義觀點和辯證思想，闡述人與自然以及生理，解剖，病理，診斷和養生防病治病方面的原則問題。成為中國醫學的基石，中醫理論體系的源泉，臨床各科診治的依據，后世奉為“經典醫籍“，為學中醫者必讀之書。是研究中醫學的重要文獻，也是中華民族寶貴的文化遺產。作為中國傳統醫學的理論思想基礎及精髓，在漢民族近二千年繁衍生息的漫漫歷史長河中，它的醫學主導作用及貢獻功不可沒。
《黃帝內經》是中醫學理論體系的淵藪，是一部綜合論述中醫理論的經典著作。它的集結成書是以古代的解剖知識為基礎，古代的哲學思想為指導，通過對生命現象的長期觀察，以及醫療實踐的反復驗證，由感性到理性，由片斷到綜合，逐漸發展而成，提出了許多重要的理論原則和學術觀點。不僅奠定了中醫學理論體系的基本框架，同時，也為后世中醫學的不斷完善與向前發展提供了可能。《內經》一書不僅是當時醫學發展水平的最佳見證，同時，也是現代中醫學研究發展的可靠基石。
首先，《內經》一書奠定了人體生理、病理、診斷以及治療的認識基礎。其基本素材來源于中國古人對生命現象的長期觀察、大量的臨床實踐以及簡單的解剖學知識。如“飲入于胃，游溢精氣，上輸于脾，脾氣散精，上歸于肺，通調水道，下輸膀胱。“(《素問·經脈別論》)以及“膀胱者，州都之官，津液藏焉，氣化則能出矣“(《素問·靈蘭秘典論》)的記載，是對人體水液代謝過程的形象描述，成為后世治療水腫病從肺、脾、腎三臟入手的理論基礎。現代治療腎源性水腫、心源性水腫多從調治肺、脾、腎入手，其理論來源顯然出自《內經》。再如，“高粱之變，足生大丁，受如持虛“(《素問·生氣通天論》)，是指過食關系。再如，《素問·五臟別論》中“氣口何以獨為五臟主“的觀點，即為后世“診脈獨取寸口“的濫觴;《素問·五常政大論》中“大毒治病，十去其六;常毒治病，十去其七;小毒治病，十去其八;無毒治病，十去其九;谷肉果菜，食養盡之，無使過之，傷其正也“的勸誡，成為中醫臨床遣藥用方、養生防病一貫默守的至理名言。
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