曹文詔于是就同游擊將領左光先、崔宗蔭、李國奇分別圍剿綏德、宜君、清澗、米脂等地的賊寇，分別在懷寧川、黑峪泉、封家溝、綿湖峪等地展開戰斗，都取得了重大勝利。掃地王被斬首。
紅軍友、李都司、杜三、楊老柴都是神一魁的余部，他們屯兵鎮原，準備攻打平涼。
練國事發布檄文要求甘肅總兵楊嘉謨、副將王性善扼住他們的攻勢，農民軍只好敗退到慶陽。曹文詔從隴州的小路出發前來同楊嘉謨、王性善會合。
崇禎五年三月，曹文詔與農民軍大戰于西濠，斬首千級，生擒杜三、楊老柴。他們的余部糾合另外的農民軍洗掠了武安監，占領華亭，又在攻打莊浪。
曹文詔、張嘉謨趕到，農民軍屯兵張麻村，明軍直壓過去，合力打擊他們，農民軍逃往高山上了。
游擊將領曹變蛟、馮舉、劉成功、平安等人吶喊著沖了上去，農民軍又一次敗逃。
這時王性善與甘肅副將李鴻嗣、參將莫與京等到來，他們一起戰斗，斬獲了五百二十多個首級。
明軍乘勝追擊，先后在咸寧關、關上鎮打敗了農民軍，追到隴安時，嘉謨和變蛟聯合夾攻，又打敗了他們。
幾千名殘余農民軍想逃往漢南，被游擊將領趙光遠阻截，于是從長寧驛逃到了張家川。
有一支從清水分出的賊寇力量較強，副將蔣一陽同他們相遇后戰敗，都司李宮用被捕了。曹文詔于是使用反間計，使其他首領上當，讓他們殺死了紅軍友，然后趕至水落城打敗了他們，追到靜寧州的時候，賊寇飛奔占領了唐毛山，變蛟率先攻上山頭，全殲了這支農民軍。
民變首領滿天飛、郝臨庵、劉道江被王承恩打敗后，退保鐵角城。獨行狼、李都司趕去同他們會合，滿天飛、劉道江于是就攜手圍攻合水。曹文詔前去援救。
農民軍隱藏了自己的精銳部隊，只讓一千多騎兵出來迎戰，引誘明軍抵達南原時，伏兵大起。
城上的人都說曹將軍已經死了。曹文詔拿著長矛來回沖擊，單槍匹馬被包圍在萬余名農民軍中間。
各軍見狀，就出兵夾擊援助，農民軍大敗，伏尸遍野，殘余的農民軍逃往桐川橋去了。
曹文詔率領曹變蛟、馮舉、張嘉謨及其參將方茂功等追上他們，沖鋒陷陣，拼命廝殺，農民軍又大敗。
不久曹文詔與寧夏總兵賀虎臣、固原總兵楊麒在甘泉虎兕凹打敗農民軍，都大獲全勝。
總兵洪承疇在平涼斬了滿天飛，降服其將領白廣恩，其余的農民軍分路逃竄了。曹文詔趕到隴州、平涼、鳳翔之間追殲他們。
這年十月，三次戰斗三敗農民軍。接著就逼向耀州錐子山的農民軍，其黨羽殺死獨行狼、郝臨庵后投降了。洪承疇殺了其中四百多人，其余的遣散回家。關中的農民軍這下子略略被剿平了。
巡撫御史范復粹在遞給朝廷的奏章中總計歷次戰斗**獲首級三萬六千六百多，曹文詔的功勞第一，張嘉謨第二，王承恩、楊麒又在其次。文詔在陜西時，大小幾十次戰斗，立功最多，洪承疇卻沒有給他記功。巡按御史吳生生十分推重文詔，復粹也再次上書匯報，但兵部還是壓低他的功績，最后還是沒有給曹文詔論功行賞。
在這個時候，農民軍看到陜西兵力強盛，就大都流入山西，他們的首領紫金梁、混世王、姬關鎖、八大王、曹操、闖塌天、興加哈利分別統帥七大營部。
每部人數多的有一萬人，少的也有五千人，在汾州、太原、平陽等地肆意活動。