趙高是支持他的人，如今趙高要涼了，他如同沒了左膀右臂。
可接下來，他恨不得手刃趙高。
……
秦二世三年，九月，丞相趙高逼殺秦二世，去秦帝號，立子嬰為秦王。
五天后，子嬰誅殺趙高。
十月，項羽率軍進入咸陽，屠城縱火，殺害子嬰。
事情要做秦始皇在巡游途中去世，胡亥矯詔篡位，聽信趙高讒言，將蒙恬、蒙毅兄弟二人囚禁起來，準備處死他們。
子嬰向秦二世進諫說：“我聽說以前趙王遷殺良臣李牧，而改用顏聚；燕王喜暗用荊軻的計策，而違背秦國的條約；齊王建殺他的先世忠臣，而用后勝的謀議，這三位君王，都各自因為改變舊規而喪失國家，殃禍降到自身，現在蒙氏一族，都是秦國的大臣和謀士，皇帝卻要在一時之內舍棄他們，除掉他們，我認為這不可以，我聽說輕于思慮的人不可以治理國家，不能廣納眾智的人不可以保全帝王，誅殺忠臣而任用沒有節操品行的人，這是對內讓群臣不能相互信任，對外讓戰士的斗志分離！我認為不可以這樣。”
但秦二世不聽子嬰的勸諫，派人殺死蒙恬和蒙毅。
不久，秦二世胡亥又在趙高的蠱惑下，對大臣以及始皇帝的皇子、公主展開血腥大屠殺，子嬰有幸逃過此劫。
秦二世三年，完全掌握了朝政，野心極度膨脹的丞相趙高試圖自立為帝，通過指鹿為馬清洗朝堂后，派女婿咸陽令閻樂逼殺了屠盡兄弟姊妹成為孤家寡人的秦二世胡亥。
秦二世死后，趙高召集大臣告知誅殺秦二世的情況，然而發現群臣和將領們都不支持他，不得不迎立子嬰。
但趙高也留了一手，聲稱六國故地相繼起事，秦已失去對境內的控制權，并說：“秦本來只是諸侯，始皇統一天下，所以稱帝，六國各自獨立，秦國地方更狹小，竟然以空名稱帝，這樣不行，應該像以前一樣稱王，才合適。”
故而子嬰不該再稱皇帝，只適合當王，并讓子嬰齋戒，到宗廟參拜祖先，接受傳國璽。
趙高稱子嬰為秦王，其實是為了日后自己繼續篡位做準備。
齋戒五天后，子嬰和他的兩個兒子以及宦官韓談商量說：“丞相趙高在望夷宮殺害秦二世，害怕群臣誅殺他，便假裝申張正義立我為王，我聽說趙高竟與楚國相約，滅掉大秦的宗族后稱王，如今讓我齋戒朝見宗廟，這是想在宗廟趁機殺掉我，我裝病不去，趙高必定親自來請，趙高來后就殺死他。”
于是，子嬰便假托生病，不理朝政，趙高數次派人來請子嬰，子嬰不去，趙高果然親自前往子嬰所在的齋宮，說：“朝見宗廟有關國事，大王為什么不去？”
趁此機會，韓談刺死趙高，并誅滅趙高三族，在咸陽城內示眾。
秦王子嬰元年，十月，項羽率大軍攻破武關。
此時，群臣百官都背叛大秦而投降項羽。
一個月后，項羽率領大軍攻入咸陽，立刻殺死子嬰，縱火焚燒秦宮室，并進行大屠殺，大秦累代之積至此一炬而盡。
嬴子嬰在位，僅46天。
在后世，嬴子嬰的身份一直是個謎。
有人說他是扶蘇之子，胡亥兄長扶蘇的兒子，名嬰。
有人說他是始皇之弟，秦始皇的弟弟，名子嬰。
子嬰的遭遇、才干及影響力絕非秦二世或同輩所能及，胡亥對待自己的兄弟絕不手軟，子嬰若是胡亥的兄長，為何能存活下來？
第三個說法是子嬰仍胡亥之兄，胡亥的兄長，始皇帝的兒子，名子嬰。
這種說法比較最站不住腳，趙高、李斯、胡亥要密謀除長以立幼，只要嫡長子扶蘇或者其他比胡亥年長的秦始皇之嫡子活著，胡亥就沒有資格即位。
胡亥繼位之所以名正言順，就是因為他是當時秦始皇存留在世間的唯一的年齡最大的嫡子，包括扶蘇在內的胡亥的十七個哥哥都已死去。