隨著戰局的逆轉，別動隊在蘇州河、南市、奉賢和上海縣，這支連統一的軍裝都沒有，只裝備步槍手榴彈的部隊甚至投入了和日軍的正面作戰，傷亡自然十分慘重，別動隊在淞滬會戰中的陣亡者超過2700人，幾乎相當于別動隊總人數的四分之一，受傷也有5000多人，幾乎達到了別動隊總人數的一半。
年底，北方支隊也在河北寶坻附近遭到日軍合圍，全軍覆沒。
11月上旬上海淪陷后，別動隊第一、第二支隊余部在浦東轉入敵后游擊戰，第三支隊余部撤入租界繼續在軍統領導下進行抗日活動，第四支隊基本損失殆盡，第五支隊余部則化整為零轉入地下。
1937年12月，蘇浙行動委員會軍事組長俞作柏率別動隊余部1700余人撤至安徽省祁門縣歷口鎮。
1938年1月，第一支隊余部由何行健率領經奉化撤至遂安，與軍統毛森在浙江江山開辦的游擊干部訓練班在東陽合編為別動隊浙東支隊。
隨后，戴局長將安徽和浙江兩地的別動隊余部統一整編為蘇浙行動委員會別動隊教導團，其中在安徽的部隊整編為教導第1團，在浙江的部隊整編為教導第2團，戴局長兼任總團長，俞作伯任副總團長，負實際指揮責任。
之后，老頭子命令戴局長“收容整編流散浦東及滬杭沿線的國軍，加強敵后游擊工作”，因此戴局長在江浙皖滬敵后收容整訓了大批在淞滬會戰中潰散的正規軍部隊，迄4月底，別動隊已經發展到五個支隊、一個直屬大隊以及南京行動總隊、上海行動總隊，連同教導第1團、第2團，總兵力又恢復到一萬五千余人。
總數多了起來，接下來出現了一個問題：那就是武器的問題。
每一次的戰斗，就會死去一批人，丟失一批槍。
現在，南京蕪湖也經被日軍占領，國軍的武器彈藥，根本就不能運到江浙滬來。組建的軍隊，有的三個人一支槍，更多的人手上沒槍，只有大刀。
這樣的實力如何去同日軍作戰。
也就在這個時候，周云向局長匯報，在上海，日軍有一個秘密倉庫，里面都是國軍的武器彈藥。
戴局長一聽，心花怒放。這天熱了，就有人送冰水！
戴局長詢問，能不能弄些出來，哪怕是幾千支槍也行。
周云知道局長弄那個忠義救國軍的事，也知道他缺槍。所以，周云同意了。
他準備向那個倉庫動手。不僅僅是因為軍統需要，周云還知道，江北的紅黨游擊隊也需要。
放著那么多的武器睡大覺，何不讓它們為了中國的抗戰大業，出一份力量。