可歷史上的崇禎卻一股腦兒把他們定為閹黨，然后將他們驅逐出朝堂，請出東林大佬韓爌擔任內閣首輔，并讓東林黨人占據朝堂大多數席位，形成“眾正盈朝”之勢。
然后在東林黨人的忽悠下，崇禎為了一個“仁君”的虛名，廢棄礦監稅、工商稅、海貿稅，以致于國庫空虛，不得不對農民加田稅加三餉，導致民變愈演愈烈，最后淪為亡國之君。
“決不能讓東林黨上位，黃立極、施鳳來等閣臣雖非名臣，節操也不怎么樣，但他們至少能服從朕的命令，愿意為國家效力，朕必須支持他們，讓他們把位置給占住了。”
朱由檢當然知道，在明末這個比爛的時代里，東林黨的道德品質是遠比閹黨高潔的，但東林黨罪大惡極的一點便是治國無能，大用他們，自掛東南枝就指日可待了。
而所謂閹黨的文官們，道德品質比東林黨差多了，李闖打進北京城，最先投靠李闖的便是閹黨的文官們。
但是閹黨文官雖爛，好歹他們還能有效地治理國家呀，所以朱由檢很快就做出決斷，所謂使功不如使過，黃立極、施鳳來等閣臣都是有污點的大臣，他們被東林黨打為閹黨，想必心中肯定是惴惴不安的，深怕東林黨上位之后對他們反攻倒算。
如此一來，他們只能團結在朱由檢周圍，牢牢抱住朱由檢的金大腿，才能保住一家老小的身家性命，甚至繼續掌握朝政大權。
而朱由檢有了黃立極、施鳳來等閣臣的支持，便可假借他們的名義行改革之實，建工廠，興教育，強科技，練新軍，收商稅，開海貿，攤丁入畝，官紳一體納糧……，一步一步，把大明朝從深淵里拉回來，并走上工業革命之路，與當時正處于航海大時代的西方白畜們爭鋒。
……
外朝方面，朱由檢確立了拉攏閹黨、中立黨繼續打壓東林黨的政策后，很快又開始琢磨起內廷來。
從這些天的表現來看，朱由檢已經確認，魏忠賢果然沒有謀朝篡位之心，天啟死后，魏忠賢對朝政的興趣也大不如前，能求得一個善終，估計魏忠賢也就滿足了。
原本朱由檢是想向起點穿越崇禎文的同僚們學習，利用魏忠賢來打壓東林黨的，但是他很快又想到一個可能，倘若魏忠賢一直在朝的話，那么東林黨就會發起無休止的政治斗爭，誓要將魏忠賢趕出朝堂為止。
如此一來，東林黨和閹黨勢必重蹈覆轍，陷入永無止境的黨爭之中，哪里還有人來為他做事啊！
“朕要施行改革，朝堂就不能大亂，看來魏忠賢得暫時下臺了，崔呈秀、田爾耕這閹黨兩大鐵桿也得趕出朝堂，只要沒了這三大靶子，想必東林黨人會安靜下來，好好為國出力吧。”
說實話，東林黨雖然在后世被罵得狗血淋頭，但朱由檢亦認為，在這個比爛的時代，一部分在歷史上已經證明過忠誠的東林黨人，還是值得一用的。
后世人之所以有東林黨人大批投降清廷的印象，其實有失偏頗，皆因時任東林黨魁的錢謙益影響力太大，再加之“水太涼”的名聲臭不可聞，以致于后世許多人把東林黨視為明朝滅亡的主因。
在錢謙益投清之前，其實東林黨人可謂節操滿滿，要么臨危一死報君王為崇禎殉葬，要么南下輔佐南明君主繼續抗清，鮮少有東林黨人敢冒天下之大不韙投清的。
但錢謙益投清之后，大批東林黨人這才節操落地，掙脫了道德枷鎖，爭先恐后地投入我大清的懷抱。
從這點來看，錢謙益留下千古罵名還真的不冤。