隨后，在進行頒發畢業證、學位證和榮譽證書的時候，秦元清親自給63名“水木大學優秀博士畢業生”、119名“水木大學優秀碩士畢業生”頒發了畢業證、學位證以及優秀畢業生獎章，從某種意義上來講，優秀畢業生獎章的含金量還在畢業證、學位證之上，也為了體現對優秀畢業生的重視和肯定，優秀畢業生獎章是專門設計的、采用99.9%的黃金打造而成，每枚獎章244.5克，上面刻著優秀畢業生的畢業年、院系、名字。
秦元清不但將畢業證、學位證親自交給優秀畢業生，還親自給他們帶上優秀畢業生獎章，并將獨屬于優秀畢業生特殊獎100萬元交到學生手中，一起合影。
這都是屬于優秀畢業生的特殊待遇，也是需要秦元清親自頒發畢業證、學位證的。
至于其他畢業生的畢業證書、學位證書則是由各個院系的院長、系主任頒發。
今天過后，大部分的博士畢業生都會離開水木，前往各個崗位，畢竟每年只有一小部分的博士畢業生能夠留在水木博士后工作站，成為研究員或者講師，更多的是去其他高校、研究機構、企業、政府事業單位或者國企之類。
而研究生，倒是有比較大比例會進一步在水木大學深造，或者去其他大學深造，就是出國留學也是有的。
畢業生們都在畢業典禮結束后，不斷去校園各處拍照，與同學合照，與老師合照，與校領導合照，與父母合照，盡可能地將這段美麗的歲月留在照片之中，因為今天之后，一天都會不一樣了。
對于學生的合照留影的要求，秦元清也是來者不拒，盡可能地滿足學生的愿望，畢竟這一屆畢業生是極其特殊的，是秦元清成為水木掌門人后，第一次頒發畢業證書的，也是秦元清第一次以水木掌門人的身份參加畢業典禮。
所以這一場畢業典禮，是一場特殊的畢業典禮！
到現場參加學生畢業典禮的家長們，紛紛對于秦元清等學校領導表示感謝，感謝他們將自家的孩子培養成才。秦元清覺得，對于高校而言最大的榮譽，不是在世界大學排名前進多少位，也不是獲得了上級多少辦學經費，而是來自于學生父母這一份肯定。
這一天，是屬于研究生畢業生以及他們父母的一天，這一天過后，一天都不一樣了，畢業生也要踏上人生的下一階段，不管是讀博，還是踏上工作崗位，都是人生的又一個新的階段。
“徐嵐，想好接下來去哪里了么？”秦元清單獨找上一位女生，這位女生和秦元清同歲，都是90后，也是同一年進入水木大學。之所以秦元清對于徐嵐印象深刻，是因為徐嵐是極為少有的獲得了水木大學優秀學士畢業生、水木大學優秀碩士畢業生、水木大學優秀博士畢業生！
在學校公示優秀博士畢業生后，徐嵐得到了極大的曝光度，引起了社會很大的轟動。