在福州停駐大半個月，清理震懾一番周邊海商后，艦隊一路南下直往濠境，此地住著不少的葡萄牙人，更有葡萄牙王室在此做總督。
濠境居住葡萄牙人一事由來已久，他們依賴“謙卑的態度和禮物”使廣東海道及相關官員自此視而不見。
之后前往濠境的葡人逐年增多且至于攜家帶眷，一些不法分子拒受漢官約束，不遵大明法度，招致廣東地方乃至朝廷詬病，遂有嘉靖末年朝野上下“驅逐澳夷”之聲，有識之士紛紛敦請朝廷對澳門葡人嚴加管理，不同趨向的建言策論為此還展開了長期而激烈的爭辯。
雖然有這樣的言論，但是一直沒有施行，反倒是國家實力開始衰退時，朝廷為了對澳葡控馭策略、貿易、稅費和防務等方面考慮，明朝廷在反復權衡之后決定放棄以飭令或武力驅逐的辦法，改而接受張鳴岡和霍與瑕等人的奏請，允準葡人繼續租住澳門，但須加強防范和管理，即所謂“建城設官而縣治之”。
也就是說居住在澳門的葡萄牙人是被看作中國皇帝子民的，葡萄牙人犯罪可由葡萄牙人自行處置；但一有牽涉華人，則須交中國官員審判，常有葡萄牙人被送去廣州審判而受鞭打。
不過自進入天啟之后，葡萄牙人就以荷蘭人入侵為借口，擅自修建防御工事，此事是官府不可容許的事情。
正所謂“普天之下，莫非王土”，朝廷對于澳門土地的管理是十分嚴格的。
朝廷雖然允準葡人居留澳門，但明文禁止他們在此擅自興作：不僅規定葡人不得買賣土地，還規定不經廣東地方官員準許，也不得在澳門建造房屋或改造、擴建房屋，否則要受到明政府的干預和懲處。
例如1614年廣東官府頒布五款《海道禁約》，其中之一便是“禁擅自興作”的規定：“凡澳中夷寮，除前已落成，遇有破爛，準照舊式修葺，此后敢有新建房屋，添造亭舍，擅興一土一木，定行拆毀焚燒，仍加重罪”。
據地方志載：“時徐如珂署海道副使，澳夷奔告紅毛將犯香山，請兵請餉請木石以繕垣墉，如珂昌言于兩府：‘此澳夷嘗我也’。
已而夷警寂然，而澳夷日筑百丈，如珂遣中軍領兵戍澳，諭之曰：‘垣墉不毀，澳人力少也，吾助若毀。’不兩日，糞除殆盡”，自此葡人稍戒心。
1624年澳門總督馬士加路也借口防御荷蘭侵擾而在青洲筑城，建起三巴寺等六座炮臺，又筑南、北兩段圍牌，并在沙梨頭一帶建造一個規模巨大的城堡，城堡周圍的高墻上環架數十門大炮，并建一道夾墻與大炮臺相通；他還計劃在中間空地建筑宮殿和高塔作為自己的駐地。
此事被兩廣總督何士晉得悉，他不能容忍他們如此任意興建城堡，遂傳令澳葡予以拆除，但馬士加路也蠻橫拒絕，于是何士晉與已升任領西道的蔡善繼通力合作，“首絕接濟，以扼夷之咽喉；既縶攬頭，以牽夷之心腹；官兵密布，四面重圍；嚴拿奸黨，招回亡命”。
面對大明官府的舉動，馬士加路不得不拆除這些防御工事。可見廣州方面對于濠境的管理還是有效的。
這一次水師抵達濠境，就是朱園想解決此事，聯合艦隊出現在濠境海面上時，當地參將陳軒榮帶著葡人總督馬士加路和他的手下前來迎接。