之后，在陸陸續續的小規模軍事行動中，三師、四師一旦打下某個莊園，必然有政工人員組織莊園里的印第安人、黑奴什么的出來現身說法，然后再開訴苦大會，之后公開批判、處決罪大惡極的農場主……幾次流程搞下來，廣大的印第安士兵，對政委同志的信任和心理依賴，迅速的超過了以前的軍事主官李自成和張獻忠。
在拿到了軍心，特別是讓兩個根據地里的普通印第安人徹底歸心后，孫傳庭才給李自成和張獻忠發令：把你們的部隊全都開過來！以前我們的任務是到處點火，讓更多的印第安人知道我們的存在。現在斗爭目標改變了：我們要集中力量，打下一座大城市，然后以此為根基，建立我們全新的根據地。我們要在這個根據地里，建立一個由印第安人當家作主，我大明官員做顧問并提供軍火貿易的，真正的印第安人的國家！
在孫傳庭看來，不管以任何形式建立一個印第安人的國家，在這個時候都是必須的了：李、張等人來了美洲已經八年了，蒂雅返回美洲更是超過了十年。在這么長的時間里，連個‘國號’都不亮出來，你怎么發動廣大美洲的印第安人來參加你的隊伍？
他是這么看的，也是這么做。但是他的這個決定，對于這些年自由散漫慣了的李自成、張獻忠來說就非常痛苦了：這算不算把基業拱手送人？
可惜，此時的大明與歷史本位面1636年的大明比起來，完全就是兩個概念。而且和歷史本位面上李、張二人率領的是漢人部隊不同，這會兒他們手下九成九以上的都是印第安人啊——而且是被政委們收了心的印第安人！
所以這會兒李自成和張獻忠心里有再大的不滿，也提不起反抗的念頭。在各種糾結痛苦后，最終還是老老實實的率領部隊，找到最近的海岸線，登上大明海軍的船只，最終來到利馬附近登陸、集中。
在這長達大半年的整軍、轉移的過程中，孫傳庭充分利用了美洲地廣人稀的特點：在李、張二人轉移前，讓兩人派出小部隊，一路向北，一路向南，沿途盡可能的暴露行蹤，表現出一種老子在這里堅持不下去了，要另外找地方發展的姿態了。成功的把拉伊蒙多和克倫威爾的主力從墨西哥城以及布宜諾斯艾利斯給牽走了。
到了1636年的4月，整個美洲兵團完成合體后，孫傳庭下令：海陸合擊，猛攻利馬。
此時的美洲，對于本土只有一千多萬人口的西班牙來說，實在是太大了。所以西班牙在美洲的殖民統治，只能是以城鎮為核心，然后通過城鎮派出規模不一的隊伍尋找周邊的各種資源，之后讓印第安人和非洲來的黑奴去開采資源，或者是開建大型種植園。
這些城鎮里，在西班牙還無力對北美有效開發的情況下，最北端的核心城市就是墨西哥城，南方就是布宜諾斯艾利斯。而中間的，就是利馬。
現在，孫傳庭就是要拿下這里，然后以此為據點，建立獨立的印第安國家。
利馬是港口城市，所以在這次攻城戰中，為美洲兵團提供火力支援的，不是陸軍常用的75mm后膛炮，而是海軍五千噸級蒸汽鐵甲艦上的二十余門150mm艦炮！
也正是因為如此，所以利馬被破城的速度極快：4月13日發動進攻，17日就被拿下了。
雖說亨利大公最終還是在明軍沖入城內前十分鐘安全后撤了，但是利馬的丟失，將西班牙美洲殖民地的陸上交通給打斷了。這對于沒有巴拿馬運河的西班牙來說，是極為慘重的損失。
由于美洲大陸的遼闊，到了五月下旬的時候，墨西哥方向的拉伊蒙多和阿根廷方向的克倫威爾才收到利馬陷落的消息。大吃一驚的兩人除了率領各自主力折返外，也各自派出信使向歐洲的菲利普報告、請罪！