農業社會的一個最大的問題在于：人口是要不斷繁衍的，而土地就只有這么多，地力也終究有限，時不時的還要遭受天災......就是正常發展下去，人均持有土地的面積都會越來越少，最終導致大家都活不下去。更不用說，在大明，土地兼并是怎么都無法解決的痼疾了。
所以，從宣德年間開始，在大明國內太平了幾十年后，就出現了軍戶土地被軍官、地方政府侵占，軍戶日子越來越差，最后不得不大量逃亡的問題。到了正統、景泰年間，于謙大筆一揮，就從兵部的賬冊上注銷了一百萬軍戶——這些事實上都確實不存在了。
時光荏苒，大明在景泰初年打了一場北京保衛戰后，又太平了許久。人口繁衍日盛，土地兼并愈演愈烈。不光是軍戶大量逃亡，就是民戶也開始出現逃亡——土地越來越集中在了少數人的手里。
而在一個傳統的農業社會，能夠提供的就業崗位是極為有限的。失去土地的軍戶、民戶，又找不到新的生發，只能是要么賣身為奴，要么成了流民——不然為啥大內每年招宦官，都是門庭若市，各種招呼、紙條滿天飛？沒有關系的人想做宦官往往先自切三寸，養好了傷口后再去應聘：如此，大內招進去后可以馬上干活，不用養傷，和普通人應聘比起來稍微占點優勢。
但這么做風險實在是太大了，因為自切三寸都不一定能進得去。那大家為何還這么做？還不是找不到正經職業的人實在太多了！
要解決這樣的問題，辦法有兩個，第一，對外擴張，用其他民族的土地來安置本族百姓。第二，提高生產力，尤其是開展工業化。如此，第二產業，以及因為社會財富的增加迅速發展起來的第三產業，就會提供更多的就業崗位，容納下在第一產業中被驅離的這些人。
所以，為什么朱由棟穿越過來都二十多年了，才開始整頓軍戶，原因就在這里：東南亞的納入，以及大明工業革命的發端，使得前面的兩條都滿足——如果這兩條都不滿足，只是為了減少開支就進行裁員，那，要么像歷史本位面的九千歲，裁出一個鄭芝龍來。或者是像崇禎帝一樣，裁出一個李自成......
總之，裁員這個事情，作為公司老總都不能隨便裁。作為國家的統治者更不能隨便裁了：你得給人家事先找好出路啊。
按照朱由棟的設想，在目前國家鹽稅、商稅步入正軌，即將新增礦稅這個大項，同時距離預想中與歐洲決戰尚有一段時日的時刻。國家養三十萬常備軍也就差不多了。剩下的軍戶，可以去做武警（駐屯軍）、警察（差役）、工人，實在割舍不下土地的，那你去海外吧，那里的土地一年兩三熟，可不比現在大明北方因為小冰河的原因，十年九旱，一天到晚都歉收的強？
給貧困至極的幾百萬軍戶找一條出路，借此減少朝廷的負擔（朝廷該養的是能戰斗的軍隊，而不是不能戰斗的軍戶），把有限的財力用來練出精兵，進一步增強國家軍事實力。這才是本次軍改最根本的目的。至于軍銜，那只是附帶，純屬穿越者個人的喜好。
大明剛建國的時候是有大都督府的，大都督之下是各個衛所的千戶、百戶、總旗、小旗。但是大都督府的權力實在是太大了，軍方的裝備、訓練、軍戶日常生產、武將選拔等權力，全都屬于大都督——這種情況，別說老朱這種掌控欲超強的開國之君，就是普通的皇帝都睡不著覺。所以自徐達之后，大都督府很快就被關閉了。