鄭家軍中軍，鄭芝龍那龐大的西式座艦上，鄭芝龍站在船尾舵樓上，讓親兵發出命令：“快船和舢板出擊，攔住趙逆火攻船！”
一條條蜈蚣快船和小舢板從水師大船之中沖出，迎著趙之龍的火攻船沖去。
趙之龍見狀，下令快船和小舢板殺出，企圖攔住鄭家軍的快船和小舢板，阻止鄭家軍破壞自己的火攻船。可是趙之龍畢竟是一名紈绔子弟，忻城伯世襲第七代子弟，整天吃喝玩樂，怎么打仗的本事早就不會了，還要讓他指揮水師作戰，也真是難為了他。
無論是數量上、火力上還是水兵訓練方面，趙之龍的水師都遠不是鄭家軍水師對手。雙方的蜈蚣快船和小舢板進入近戰之中，鄭家軍的快船以佛郎機炮和斑鳩腳銃轟擊對手，彈如雨下，打得明軍長江水師船上的官兵紛紛落水。鄭家軍的快船憑借著數量上的優勢，同時對付趙之龍的快船和小舢板，打得趙之龍的水師狼狽逃竄。
鄭家軍小舢板殺向火攻船，小舢板上的鄭家軍水兵取出弓箭，什長打開火種罐，點燃了火把，水兵們拉開弓箭，什長以火把點燃火箭，水兵們手指一松，一支支火箭向趙之龍的火攻船飛去。
滿天飛蝗般的火箭落在火攻船上，轉瞬之間就燃起了熊熊烈火，操縱火攻船的明軍水兵只好跳上后面的小船，逃離起火的火攻船。
解決了趙之龍的火攻船后，鄭家軍水師主力戰船殺向了趙之龍水師的主力戰船，雙方在江面上展開了一場激戰，錯了，應該是是鄭家軍水師對趙之龍水師一邊倒的屠殺。
趙之龍損兵折將，大船幾乎全部丟干凈了，就連他自己的中軍座艦，也中了多枚紅夷大炮的炮彈，打得船上士卒死傷慘重。慘敗的趙之龍帶著殘兵敗將和殘存的戰船，逃回了對岸鎮江岸邊。
“相爺，趙之龍敗了，已經無法阻止昏君崇禎渡江！”保國公朱國弼臉色凝重，匆匆忙忙的闖入了內閣，向首輔馬士英稟報。
“保國公，你們勛貴手里還有多少兵？”馬士英問道。
朱國弼、趙之龍、徐久爵、劉孔昭再加上態度還不確定的常延齡，南京京營的軍隊尚有五萬大軍，再加上馬士英等人招募守城民壯，可以拼湊出一支十萬人的軍隊駐守南京。
事實上南京京營的兵已經是爛到無可救藥了，比京師大營的兵還要爛，都是屬于不堪一擊的那種類型，南京京營的兵，可以說每一個小兵都是實世襲勛貴子弟，指望他們能打仗，還不如多拜拜佛祖，多燒幾柱高香，說不定還能天降隕石砸死崇禎。
不過對于馬守應來講，有一點好處就是南京堅城固若金湯，以李國棟和鄭芝龍的十多萬聯軍想要攻破南京并非易事，李國棟的六萬大軍有一萬五千人是水師，扣除了輔兵和騎兵，真正能用來攻城的步兵只有兩萬；鄭芝龍的五萬大軍大部分都是水師，能登陸作戰的步兵只有一萬，以三萬人要攻打南京，恐怕很吃力。
更何況南京城內還有百萬百姓，只要馬士英他們把城內百姓也動員起來，那就有數十萬守城大軍了。
被弘光偽帝派遣去九江同清軍使者談判的黃澍、左懋第、馬紹愉和陳洪范等人已經到了九江，雙方談判進展順利，左良玉也答應了清軍使者陳名夏提出的要求：左家軍東進勤王，當然勤的是朱由崧這個王。
陳名夏道：“左將軍，李老二軍隊雖然精銳，但是兵少。南京城池堅固，李老二這點人根本就不可能攻克南京！只要他的軍隊陷在南京城下進退不得，你的八十萬大軍即可一舉殲滅這個逆賊！”