桔梗山戰役木葉大勝，不僅將砂忍徹底趕出火之國，還在山上捉了許多俘虜，包括小部分砂忍以及大量風之國平民。
而砂忍退出火之國，也代表著兩國的戰爭將以木葉的勝利做為結局，而帶來這一切的是大蛇丸！
于是順理成章的，大蛇丸的名望瞬間達到頂峰，當他帶著俘虜回村，木葉無數平民夾道歡呼，萬人空巷。
猿飛日斬站在火影樓的天臺上，眺望著這一幕，眼中卻有幾分凝重以及遲疑。
和砂隱村的戰爭暫告一段落，所以他派去協助大蛇丸的暗部也已經提前一步回來。
從暗部嘴中，猿飛日斬察覺到了一些身處地底的黑暗身影。
根部！
猿飛日斬的思緒逐漸飄到了過去。
四十多年前，木葉建立沒多久，號稱忍界之神的初代火影千手柱間去世了，他死后，木葉失去木遁，在忍界地位一落千丈，沒多久就爆發一戰，二代火影也掛了，之后猿飛日斬繼承三代火影。
為了盡快提升村子的實力，猿飛日斬同意團藏的要求，允許他以‘暗部培訓部’的名義成立根部，之后，為了預防九尾暴走的威脅，猿飛日斬又和團藏一起利用初代的細胞做人體實驗，企圖培育出新的木遁忍者！
沒錯，利用千手柱間細胞做人體實驗的除了團藏，猿飛日斬也做過！
但遺憾的是，他們的人體實驗全部失敗，作為實驗體的志愿者們也無一例外全部死亡。
猿飛日斬無奈，只得叫停實驗，然后將實驗的數據、記錄等作為黑歷史封存起來。
之后爆發第二次忍界大戰，猿飛日斬的三個弟子，大蛇丸、自來也、綱手闖出了三忍的名號。
同時團藏的根部也活躍起來，到處搜集尸體和俘虜，猿飛日斬一看，暗想小老弟你是不是背著我偷偷的搞人體實驗？
于是猿飛日斬將大蛇丸派過去給團藏當親隨，一是為了表示對團藏的信任與器重，二是監視團藏以及他的根部有沒有在繼續做人體實驗！
通過大蛇丸，猿飛日斬確認了團藏沒有繼續研究，或許是抱著愧疚的心思，之后猿飛日斬對團藏更加信任，放權的尺度也越來越大，沒過多久，猿飛日斬就隨便找了個理由讓大蛇丸離開了根部。
猿飛日斬以為事情就這樣結束了，直到現在。
從暗部的匯報中，他發現跟隨大蛇丸前往砂忍戰場的除了暗部忍者，還有團藏的根部忍者。
而且到了戰場后，大蛇丸竟然將暗部忍者統統打散調入各個部隊，而根部忍者，卻被他全部留下充當護衛隊！
也就是說，相比起猿飛日斬這個老師的暗部，大蛇丸更加信任團藏的根部！
在確認了大蛇丸和團藏的親密關系后，受傷的猿飛日斬不得不懷疑大蛇丸在根部監視團藏時傳回的情報的可信度。
團藏，真的已經停止了人體實驗？
接著，猿飛日斬立即查看了大蛇丸抵達前線后，木葉大營后勤記錄的尸體數量，發現村子忍者的尸體沒少，但砂忍的尸體卻是一具都沒有！
要知道在大蛇丸之前，他們可是繳獲了不少砂忍尸體，甚至是活著的砂忍俘虜，但大蛇丸到前線后，生不見人，死不見尸！
擺明了是被大蛇丸拿走了。