對蝦夷地北海道和庫頁島的拓殖方面，合眾國相對日本來說是后來者，早在十五世紀，日本人就登陸了蝦夷地，在那里建立了和人地，接著松前藩從豐臣秀吉和德川家康手中獲得了對蝦夷地的支配權，日本人順著蝦夷地海岸線北上，很快就在庫頁島南部建立了小規模的捕魚點，并且展開貿易。
在日本人之前，來自大陸的土著和庫頁島的土著就有貿易，在元代的時候，一些絲綢從蝦夷地方向輸入，一度被叫做蝦夷錦，后來日本人加入，把在庫頁島進行的貿易稱之為山丹貿易，日本人用鐵器、鹽和衣服換取乞列迷、索倫等部的獸皮、金沙和魚獲。
而山丹貿易和日本擅自把庫頁島列為領土都一系列行動，滿清政府都處于茫然無知的狀態，一直到社團開拓到了這個地方，先后占據了黑龍江兩岸和庫頁島。
一開始，合眾國無視了日本對庫頁島的開拓，進入庫頁島進行拓殖活動，實際上，這種無視并非有意，一直到崇禎十六年之前，合眾國甚至從未發覺日本人的漁民，只是知道有山丹貿易這種事，后來，合眾國參與了山丹貿易，手中大量的文明國度商品迅速把日本商人擠出了市場，而松前藩索性與合眾國進行貿易，生絲、茶葉和生鐵進入松前藩手中，換取了木材、奴隸和金銀，山丹貿易成為了兩國之間半合法的貿易。
而合眾國對北方的開拓從未停止，特別是對蝦夷地周邊，因為捕魚和捕鯨活動，在拓殖開始后的數年里先后占據了千島群島各個島嶼，并且在上面建立定居點和村鎮，完成了事實占領，為了增加南北航線中轉點，為東方港的船只安排更近的不凍港，蝦夷地西部的附屬島嶼利尻島被選中，這個受日本暖流影響而全年不冰封的島嶼成為了東方港的冬季錨地，而上面還建設了一些建筑和別院，供東方港的一些富商和高官過冬。
因為蝦夷地并非松前藩的核心利益區，而新式的山丹貿易帶來了大量的利潤，讓松前藩對合眾國的拓殖表現出了默認的態度，在原本的歷史中，松前藩在崇禎十七年44年向幕府進貢的全國地圖正保御國繪圖中，蝦夷地和庫頁島都列為日本領土，而在現在這個時空中已經沒有庫頁島和蝦夷地周邊的附屬島嶼。
隨著大量移民進入永寧行政長官區，解決糧食問題成為了永寧行政區的首要問題，在廣袤的黑龍江、烏蘇里江兩岸，哪怕是肥沃的黑土地上，也無法種植稻米和小麥，真正的糧食作物只有低產的燕麥、大麥，永寧行政區的主糧一直到目前為止都是土豆、玉米和紅薯，包括稻米、小麥都是從大本營和周邊國家輸入的。
永寧一直致力于解決主糧無法自產的問題，迫切的需要一塊可以種植水稻或者小麥的土地，而蝦夷地很快落入了永寧行政區的視野之中，蝦夷地這個巨大的島嶼上分部這諸多平原，包括后世被稱為石狩、勇拂、十勝等幾個大小平原，其中石狩平原還是后世日本第二大平原，盛產水稻。
未免過度刺激已經在蝦夷地南部半島扎根的松前藩，永寧行政區派遣幾個內藩和外藩部落進入蝦夷地，利用先進的武器和訓練有素的士兵，橫掃石狩平原一帶的諸多阿伊努人部落，隨后就是大批從南直隸和浙江的移民趕到，占據了石狩平原。
對蝦夷地的拓殖已經持續了四年，前兩年以軍事征服土著為主，后來則大量開墾土地，而正是因為石狩平原出產的稻米，讓合眾國與日本的關系一下緊張起來。
對于日本來說，稻米產區就意味著人口和國力，要知道，日本的各個藩國都是以石高為單位劃分的，石高大部分就是指的稻米產量，松前藩占據的蝦夷地南部半島多是山地丘陵，漁業和毛皮豐富，卻是不能種植水稻，所以松前藩也是日本少有的沒有石高的藩國。
眼瞧著合眾國在石狩平原種植出了水稻，松前藩無比艷羨，再加上日本從室町時代起就認為蝦夷地是日本領土，以至于日本的實權統治者都擁有征夷大將軍當時本州島北面也屬于蝦夷勢力的稱呼。所以從去年末開始，松前藩率先提出要求合眾國退出蝦夷地，遭到了拒絕。
而松前藩除了抗議顯然沒有其他好辦法，一方面山丹貿易利潤可觀，松前藩不想失去好不容易建立起來的貿易體系，而另一方面，松前藩實力不濟，這個沒有石高的藩國用了幾十年的時間也只占據了南部貧瘠的半島地區，對蝦夷地的拓殖斷斷續續，軍事實力本就不強，而如今合眾國在蝦夷地擁有移民兩萬余，六個內外藩部落共計萬余人，實力強橫，絕對不是松前藩可以應對的。
所以松前藩把問題交給了江戶的幕府，由幕府進行交涉，也就產生了合眾國與日本之間的外交爭端。