夜幕降臨只有的爪哇海被火光照亮，已經混戰在一起的戰團此時已經偃旗息鼓，聲音嘹亮的翻譯軍官用荷蘭語、德語、法語、爪哇土著語對船上的荷蘭人進行勸降，事實已經證明，無論是德約特還是哈魯斯都已經拋棄了他們，艦隊司令哈魯斯直接跑的沒影了，德約特的后衛艦隊還有七艘船，此時在東北方向游弋，誰都知道，天亮前他會撤走，否則就會被擁有速度優勢的巡航艦追上。
對荷蘭人造成影響的不只有翻譯官的提出的優渥條件，還有船上水手的刀劍，在巴達維亞出發的時候，每一艘荷蘭船都塞上了大量臨時抓來的爪哇人和華人，在失敗的戰事中，這些心懷怨念的人被荷蘭軍官分發了武器，他們為了活命與合眾國海軍戰斗，此時為了活命自然也是要與不肯投降的荷蘭軍官戰斗，陸戰隊一艘一艘的接管荷蘭人的船只，大大小小的帆艇在艦船之中穿梭，救助飄在海面上的人，在白日決戰的戰場，也有軍人在忙活，偶爾還會響起一兩聲的火槍，那并非海軍在處決落水水手，而是在驅逐、擊殺趁火打劫的鯊魚。
只有荷蘭軍官被陸戰隊看押起來，其余人，無論是白人、華人還是土著，都只是被收繳了武器罷了，在被俘虜之后，海軍為其了一份食物，而在天亮之后，無論俘虜還是海軍都加入到了修船之中，戰斗已經結束了，大家都是一條船上的人，船若是沉沒了，誰也撈不到好處。
最先的修船是進行損管作業，除了排水，就是堵住進水的孔洞，先保住船不沉沒再說，之后才是恢復動力，修船一直持續了三天，爪哇海戰的總結終于送達了李明勛的手中。
在整個爪哇海戰中，巴達維亞艦隊一共損失了三十九艘船，其中有被大艦隊擊沉的也有主動焚毀的，東印度公司方面，絕大部分的海軍戰艦被擊毀，逃離的船只除了一些東印度大帆船，就是巡航艦、蓋倫船一類的小型船，大艦隊一共抓抓住了八千二百四十人的俘虜，其中白人和混血在兩千八百人左右。在損失的三十九艘船中，有十二艘是被大艦隊俘獲的，實際上，巴達維亞艦隊的損失不止這些，在逃亡途中，也有一些荷蘭船只沉沒或者被丟棄，而根據東印度公司的統計，在爪哇海戰后，一共有三十五艘船逃回了荷蘭控制的各個港口，回來的人數在一萬兩千人左右，也就是多達一萬三千人戰死或被俘、失蹤。
合眾國一方的損失也非常嚴重，因為大艦隊是勝利者，所以可以非常細致的清點損失，大艦隊總計損失了十一艘船，包含三艘逆戟鯨級的主力艦，兩艘虎鯊級重炮艦，還有三艘蓋倫船，一艘巡航艦和兩艘護衛艦，此外，全艦隊所有船只都遭受了不少的損傷，在回國過程中，還有兩艘軍艦因為遭遇惡劣天氣，最終還是被放棄，爪哇海戰之中，大艦隊還能投入戰斗的船只只剩下了十四艘。
唯一讓李明勛感覺到慶幸的是，洲際貿易船和戰列艦沒有一艘沉沒，洲際貿易船是因為一直沒有承受艱難險重的任務，而戰列艦純粹是因為實力強橫，而大部分的戰果也與戰列艦有關。
大戰之后，重傷的海軍軍艦前往文島港進行維修，部分船只返回了馬尼拉和巴達維亞，而繳獲的荷蘭船只中，大部分就近在蘇卡達納、泗水等盟屬港口維修。
可以說，爪哇海戰決定了未來二十年誰是東方世界的海上霸主，而合眾國顯然抓住了這一機會，奪得了頭把交椅，雖然大艦隊損失嚴重，但逃走的巴達維亞艦隊損失更大，哈魯斯和德約特雖然逃跑方向不同，但是有一個共同認知，那就是合眾國海軍艦隊會在取勝之后前往巴達維亞，所以這二人沒有敢返回巴達維亞，德約特帶領他的小艦隊越過馬六甲海峽前往了錫蘭，在途中還突襲了檳城港和玻璃港，造成了不小的損失，而哈魯斯直接前去了香料群島，但無論哪個港口，都沒有巴達維亞的修船能力，且雙方交通聯絡困難，所以即便紙面數據上，荷蘭人仍然占據優勢，但海軍掌握了爪哇海卻是事實。
雖然在合眾國與馬打藍聯軍登陸西爪哇，發動了圍城戰后，德約特和哈魯斯都得到死命令，出戰爪哇，但那個時候，合眾國已經把戰損和繳獲的艦船維修好，在絕對實力上也占據了上風。
實際上，哈魯斯和德約特的預料非常準確，在確定了控制戰場局面之后，李明勛以鷹艦隊為主，重組了一支特混艦隊，包含了四艘戰列艦和三艘重巡以及沒有受損的七艘風帆護衛艦，執行對巴達維亞港口的封鎖，這支艦隊由李北極率領，于五天之后抵達了巴達維亞，并趁夜用熾熱的炮彈炮擊了巴達維亞城，用炮彈向巴達維亞的居民宣告，誰才是這片海洋的主宰。
李明勛和西蒙斯率領大隊艦船返回了文島港，并用通報船把爪哇海戰勝利的消息傳遍了合眾國所有的行政區和所有的盟友，并且在臺北和香港兩地舉行了兩場獻俘儀式，徹底宣告海戰的勝利。
雖然海軍陸戰隊一直在邦加島和北大年枕戈待旦，但李明勛沒有貿然發動登陸作戰，那個時候，他還不知道德約特逃往了錫蘭，哈魯斯前去了香料群島的安汶和班達，在失去敵人蹤跡的情況下，李明勛必須做最壞的打算，那即是這些依舊擁有戰斗力的船只會進行破交作戰，忙碌航道的商船暫且不提，李明勛必須要為跨海登陸的陸戰隊足夠的防御，而且此時的風向也不對，在于馬打藍蘇丹等幾個盟友商議之后，李明勛選擇在年底十二月發動對巴達維亞的總攻。