反對派要求解散東印度公司，成立一個新的東印度公司。而新上任的威廉三世為了迎合議會，取消了東印度公司的特權。隨著新的東印度公司成立，老公司的地位岌岌可危，而正是托馬斯親自解救公司。
托馬斯在聽說之后，一邊聯絡查爾德，讓他利用關系，促使議會授予新東印度公司壟斷權，一邊在李君威耳邊說新公司的壞話。這是一招險棋，但托馬斯爵士卻賭贏了。
新成立的東印度公司規模很大，成立了一支大船隊南下開普敦進行貿易，但是卻被開普敦地方拒之門外。開普敦地方長官直接告訴新來的東印度公司，我們只承認原來的公司，如果你們想要貿易，就必須讓英國取消壟斷權。
這個態度并非是因為李君威與托馬斯的私人關系，更重要的是原有的東印度公司更符合帝國的利益。要知道，原本的東印度公司已經放棄了殖民戰略，轉變成了貿易公司，荷蘭東印度公司也完成了轉變，這意味著，帝國在印度洋上最強大的兩個競爭對手消失了，帝國海軍也就不用維持那么大規模的印度洋艦隊。而老公司與帝國更是有其他合作，尤其是托馬斯爵士代表兩家公司與海外事務部簽訂的秘密條約，既幫助帝國打開英國市場，也幫助帝國打擊在加勒比海與北美洲的殖民地。
而新的公司顯然不能立刻繼承老公司的戰略，即便是他們有意如此，也會借機提條件的。所以，除非英國放開壟斷，否則新公司取代老公司對帝國戰略并不利。
這支大船隊被迫折返英國，只能把貨物賣給加勒比海和美洲殖民地，但這惹來了很多麻煩，因為東印度公司是特許授權公司，一般不會前往美洲搶食的。所以船隊在加勒比海就折返英國，運氣卻背到了極點，縱然選擇繞北海折返，但仍然遭遇了法國海軍，損失了十幾條船，這讓新公司面臨崩潰。
東印度公司的貿易范圍是整個東方，雖然東方有很多國家，但霸主卻只有一個，沒有任何國家可以避開帝國進入東方貿易。因此新公司立刻派人去里斯本，尋求外交解決，但里斯本早就得到了消息，態度與開普敦完全一致。
因為裕王的配合，托馬斯投桃報李，前往開普敦，直接在造船廠訂購了八艘大飛剪船，并且制定了更大規模的貿易方案。
只不過接下來的策略卻與托馬斯的設計背道而馳，按照托馬斯的設計，直接讓新公司破產，查爾德在這個過程中游說賄賂議會和國王，反正英國正與法國、蘇格蘭和愛爾蘭打仗詹姆斯二世在法國國王支持下領導蘇格蘭、愛爾蘭的天主教徒反對新國王。他們需要錢，公司給錢就能得到想要的。
但是托馬斯爵士低估了查爾德的貪婪，他不僅想交好國王和議會，重新獲得授權，更希望吞并新的東印度公司，擴大公司的規模。查爾德很快取得了成功，兩家公司合并，成立了聯合東印度公司，查爾德甚至還模仿帝國的幾家殖民公司，讓國王在公司之中占據了百分之五的股份。
可問題就出在合并上，東印度公司的很多政策是不可告人的，尤其是與帝國簽訂的秘密條約，別說英國本土的議會，就連董事會之中也只有少數人知道，這個條約之中還規定了，一旦查爾德離任，條約就會暫時中止，或者查爾德必須找一個認可條約的董事會主席接任。所以，老公司的股東們也不知道有這個密約。
但吞并了新公司后，董事會重組，新公司的一個叫帕皮倫的家伙掌管了財物委員會，雖然他不知道密約，但卻可以通過財務委員會知曉一切的貿易行為，很快就發現了貓膩。查爾德直接向他承認了密約的存在，查爾德認為，公司就是為了利潤，帕皮倫的家族也是股東之一，不會阻止這種為公司帶來利潤的密約，可惜的事，帕皮倫是一個愛國者。
帕皮倫不能接受密約，但卻也不敢撕毀。一旦密約公開，東印度公司肯定會被取締，那么這家已經擁有一百四十萬英鎊股本的大公司就會蕩然無存，畢竟這份密約是傷害了所有的英國人。而密約之中早已規定了，一旦條約撕毀，帝國授予東印度公司的貿易權限會被取消，而且也不在保證其安全，這也幾乎能宣布東印度公司死刑。
帕皮倫選擇把這件事告訴了威廉三世，威廉國王也同意不能公開，除了保住他那百分之五的股份，其實威廉國王早已秘密成為荷蘭東印度公司股東，而密約之中也包括了荷蘭方面，威廉本人更喜歡荷蘭。