此戰的后遺癥同樣明顯，沿江的蒙軍如驚弓之鳥一般，對岸的一絲風吹草動都會引發恐慌，他們不得不收縮防御，將邊遠的百戶所和千戶所集中到一起，以致土地大片荒蕪。而他們同時達成了一種默契，不要攔截渡江的宋軍小股部隊，任其來去，即便發現了也要禮送出境，不得擅自挑起戰斗。
與蒙軍全面轉入防御不同，宋軍這邊確是大肆宣傳，唯恐天下不知。趙昺深知有功立賞，有罪立罰，不懷成見，不徇偏私的道理。他在建康重賞了參戰的諸軍，自然也不能厚此薄彼，親至水門外迎接得勝歸朝的兩部水軍，并主持了獻俘儀式，頒布了嘉獎令。
與此同時，京城的報紙上亦是連篇累牘的報道兩場勝利。但是側重點卻有不同，水戰在規模上及戰績上值得吹噓的地方太多了，兩部的將領也是沙場老將，可以寫的地方太多了。相比之下，建康這場戰斗無論從規模和戰績上都要遜色許多，因此趙昺命他們將重點放在宣傳渡江分隊的堅韌和忠誠上，另外就是絕不會放棄任何一個袍澤兄弟上，其中自然隱去了他親征一節。但他沒想到卻又引發了一場風波
趙昺前世最討厭文山會海，可這世當上皇帝后卻深陷其中不能自拔，其中無奈和苦處又無處訴說。上午與劉辰翁討論了半天歸正人的問題，而下午又處分了二師的兩位主官，但他知道處理兩個人容易，善后才是最重要的，不僅要讓全軍上下引以為戒，還要加以安撫穩定住官兵情緒，不能因此而影響到部隊戰斗力。
因此趙昺在會上再次強調了軍隊的當前任務就是要打敗蒙元，收復中原，一切都要圍繞此事做文章。一切阻礙實現這個目標的，不論是何人都必須予以清除，如李鴻斌這等為官怕承擔責任而作戰畏手畏腳，沒有擔當的軍事指揮員，及如嚴岳這種濫用權力，拉幫結伙，打壓同僚的害群之馬定要趕出軍隊。
而后趙昺又在眾將的陪同下前往醫藥院看望了龐福等人，囑咐他們安心養病，然后又視察了二師駐地，召見了都以上軍官開了座談會，宣布罷免兩位主官的決定，并講明了原因，贊揚了官兵在此戰中的英勇表現，命令嘉獎一批軍兵，卻主動承擔了此戰失利的領導責任。
視察完畢后，趙昺沒有離開，而是與眾軍在食堂共進晚飯，又再次對大家進行鼓勵，要他們不要因為此戰失利而背包袱。要求他們在新任都統的領導下，加強軍事訓練再建新功，爭取下一仗打出一軍的威風，不要因此一蹶不振。
考慮到這邊的事情已經處理完畢，而自己與諸宰執約定的日子將近，趙昺便拒絕了眾將的挽留，搭乘燕子磯水營的輜重船折返回京。除了幾位高級軍官和知府劉辰翁在碼頭上送行，并沒有驚動其他人，正如當初悄悄的來，又悄悄的離開了建康
“淑妃姐姐，官家怎么還沒有醒，不會是生病了吧”
“不會，官家只是累了。自咱們到了建康，陛下便組織營救行動，結束后又忙著善后，三天三夜幾乎都沒有合眼，便是鐵人也頂不住啊”
趙昺其實已經醒了，但是正如李三娘所言自己是真的累了，懶懶的眼睛都不愿意睜，假寐著聽兩個老婆說話。雖然這不大厚道，但是他想看看他們背著自己會說些什么，做些什么，且覺得很有意思。正當他心里美的時候，突然一只手搭在頭上，嚇了他一跳，可他仍強忍著沒有動。
“官家的頭好像有些熱，要不要找醫士瞧瞧”王妤又摸了摸自己的頭，不無擔心的輕聲道，卻沒有發現陛下在假睡。