因為通過祈禱、冥思和神靈溝通的難度越來越大，獲得神靈的神術也越來越少，威力更是日漸減弱，特別是以一些對傳教最為有利的治療類神術減弱得最為嚴重，其中絕大部分治療神術只剩下一些光影幻象，只有更高級的神官、祭司或者主教才能夠發揮出一部分治療效果。
為此，正教庭不得不做出一些改變，付出一些代價，換取醫學院的支持，專門給各個教會培養一些教會醫生。
醫學院對此樂見其成，因為這會讓醫學院的影響力借助教會的勢力擴張更廣，帶來的附加利益也自然是越多。
只不過，影響往往都是雙向的，在醫學院開始影響各個教會思想的同時，教會的神靈信仰也滲透到了醫學院內部，甚至在醫學院內也建立起了一些教會神靈的小教堂，供人祈禱、禮拜。
正因為這種特殊的氛圍，使得教會醫生也開始嘗試著將各自教派的基礎信仰和醫學院的自然醫學結合到一起，試圖建立一種融合科學和信仰的新型教派。只是，這種嘗試都失敗了，最終弄出來的教派不倫不類，甚至連教會醫生都看不過去，主動將這些失敗品銷毀掉。
直到一名信仰植物之母的教會醫生約書亞無意中從醫學院圖書館獨到了這本書，或者更正確的來說獨到了這本書的序章，他就像是獲得了神靈啟示一樣，迅速的將這篇序章的內容宗教化、神格化，并且在短短不到三天時間，就編寫了一套完整的核心思想和教派體系，正式創立了治愈教會。
治愈教會的核心思想和那篇序章一脈相承，都是認為維綸世界現在已經病了，需要治療，而治療的方法兩者則截然不同，那篇文章的治療方法主要是保護環境，維護生態，而治愈教會則將維綸世界生病歸咎于神靈的消失和沉睡，所以他們認為只要神靈回歸，那么維綸世界也將重新恢復秩序。
就和維綸世界其他一些秘密學會和地下教會一樣，一開始加入治愈教會的人很少，只有十三人，醫學院的人笑稱他們為十三門徒，而約書亞則被調侃式的稱為圣子。
治愈教會建立最開始的幾年里，所做的事情也并沒有什么奇特的地方，他們做得最多的事情就是培育或者尋找一些能夠幫助各個教會教徒在冥思祈禱時更容易進入狀態的草藥，同時也和考古學界發掘一些古跡等等。
直到，某一日美加利加王國的天空之主教會突然抓捕約書亞，并且在醫學院反應過來之前，以瀆神罪將其處死，他的十三門徒，一人背叛，十二人逃散，治愈教會才出現在世界各國的眼中。
只不過，這時候更多的注意力是聚焦在天空之主教會和醫學院在正教庭打的這場宗教官司，因為這場官司會成為一個標準案例，從法律上解決宗教教規和各國司法發生沖突時所遭遇到的問題。
至于治愈教會的約書亞，更多的人是記得了他試圖偷到天空之主圣遺物的瘋狂之舉，記住了他被教會用火燒死前的那番地上神國的演講，也記住了他那個聽起來很可笑的圣子名稱。
原本所有人都以為治愈教會經過這件事以后，就會徹底的消失，可沒想到的是幾年后治愈教會竟然逐漸發展起來了，并且比起最開始要大得多，形成了一個跨教會、跨學會的特殊宗教組織，就像正教庭一般。而且，隨著成員的增多，其影響力也逐漸擴張，內部體系也跟著完善，形成了現在的十二牧首制，最終發展成了現在的龐大規模。
加入治愈教會的人絕大多數都是被約書亞死前那番地上神國的演講所吸引，既就在教會不得志的神職人員，也有崇尚科學的機械師，幾乎所有行業的人只要符合治愈教會的標準，都能夠加入進來。血巫師勞倫斯希爾曼曾經就是治愈教會的人，安妮伊芙、魯伯特菲茲和希爾維亞也曾經都是治愈教會的成員，只是后來都退出了。
之所以，希爾維亞他們會退出治愈教會，是因為治愈教會的行事手法越來越極端。
最開始的治愈教會還是一個很溫和的學術教派，探討一些人、神、世界之類的哲學思想，但隨著各行各業的人員不斷加入，教派的思想也變得越來越混亂，越來越極端。像血巫師勞倫斯希爾曼，當年推行血療療法時所做的事情，在治愈教會是絕對不允許的，為此他們主動揭露了勞倫斯的惡行，將其驅逐出教派。可現在，治愈教會所作所為和當年的勞倫斯希爾曼沒有什么兩樣，可見治愈教會內部已經被極端主義者給徹底占據了，這也是希爾維亞會咒罵那些人是瘋子的主要原因。