等到三曲翼大樓重新被神盾局掌控在手中后，馬上又開始了新一輪的清洗，每個基地都不在白名單之中，就是想要將九頭蛇徹底鏟除。
但其實每個人的心里都清楚，這只不過是亡羊補牢的做法，或許那些已經暴露，會是自露馬腳的九頭蛇間諜會被順利清理掉，但是那些還未暴露出來的人在經歷這次大規模的清洗之后，一定會將自己隱藏的更深，等待某個關鍵時刻，被新的‘蛇頭’所啟用。
但不可否認的是，這次九頭蛇想要取而代之的陰謀被打破后，九頭蛇所受到的重創將會使得他們這么多年的努力全部付之東流。
尤其是在事后徹底的搜查中，尼克·弗瑞還找到了這些年亞歷山大·皮爾斯暗中抽調神盾局內部資金用來秘密修建九頭蛇基地的證據，并通過這條線索迅速確定了大部分的位置，不僅僅只是在美國，世界各地很多地方都有，可想而知這些年，在亞歷山大·皮爾斯的幫助下，九頭蛇快速發展成了什么樣子，接下來他們有的忙了。
但就像九頭蛇的口號一樣，砍掉一個頭還會長出兩個。
斬草不能除根的后果就是早晚有一天，全世界還會面臨九頭蛇這一組織的威脅，對此就算是說出‘我還活著，所以九頭蛇完蛋了。’這樣豪言壯語的尼克·弗瑞同志也倍感頭疼，只能盡力為之，準備一邊打擊但凡敢冒頭的九頭蛇勢力，一邊壓制敵人的發展。
可以想象，在失去了神盾局這層保護衣后，躲在暗處頑強生存的九頭蛇再想像之前那樣快速壯大是不太可能的了，有太多雙眼睛在盯著他們。
而對于神盾局而言最后能有這樣的結果已經算是最大的幸運了，就算最后關頭尼克·弗瑞帶人‘力挽狂瀾’，讓糟糕的情況重新回到了正軌上，國際安全理事會還是給了他一個失職的評定，并且暫時剝奪了他的局長職務，讓他暫任代理局長繼續處理后續的爛攤子。
對此，尼克·弗瑞欣然接受了。
九頭蛇的勢力在他的眼皮子底下茁壯成長，而他卻未能及時發現，這絕對是他的失職，沒什么好說的。
而撤去他的局長職務，又給了他一個代理局長的名號，也不過是為了服眾，順便給他一個教訓。
就以目前神盾局的糟糕狀況，就算是國際安全理事會想空降過來一個局長估計都沒人愿意接手這個爛攤子，再加上尼克·弗瑞畢竟還是最熟悉神盾局的人，暫時也找不到比他更適合處理后續事件的人，于是才有了這樣的結果。
當然，尼克·弗瑞也沒忘了要給迪奧的交代。
所有參與了那件‘事故’的九頭蛇余孽全都被他派人一個不落的抓了起來，其中就包括那位演了他一手的杰森特工。
當神盾局這樣的超級勢力動真格的時候，躲到哪都沒用。
對于尼克·弗瑞的‘示好’，迪奧欣然接受了，然后某個夜晚，在父母的墳墓前他親手弄死了這些混蛋，算是了卻了一樁心愿。
也是直到這個時候他才發現，原來在不知不覺間，他與這個‘陌生’世界之間的牽連已經割舍不斷了。
也是從這一刻起，他開始真正以迪奧·布蘭度這個名字的視角來看待整個世界，而不是以一個異鄉人的旁觀者身份。