直到第3支艦隊到達，接替了外圍的警戒任務，前兩支艦隊這才發起了進攻！
進攻的過程異常順利，犀利的火炮把海盜們打得無處躲避，無法在停靠在澎湖灣里的船上藏身；躲在灘頭上也成為了活靶子，只能紛紛棄船逃往島上，借助山上的灌木和巖石藏身隱蔽，負隅頑抗！
一旦把海盜趕到了島上，接下來的戰斗節奏就完全屬于了自己這一邊了，曲射炮的吊射以及槍的準確命中，把這些以往橫行霸道的海盜打的鬼哭狼嚎，抱頭鼠竄！
要想活命，喊投降也不是件容易的事，這也需要有一定的藝術表現力！經過不少海盜不要命的嘗試，他們終于摸出了一點道道，光靠嘴里喊投降還不行，先要把兩手舉得高高的，手里不能拿刀！見對方沒有開槍射擊，這才慢慢的露出腦袋，直到第1個確認了對方不打，剩下的才敢慢慢的一個一個露出來，雙手抱頭，然后走下山來接受投降！
戰后一清點俘虜，總共抓了5000左右，有3000左右的海盜已經成了槍炮下面的鬼！
鄭芝莞見大勢已去，他不知道外面的情況，覺得無法對幾個堂兄弟交代。他不知道外面的天早已變，鄭芝龍的勢力和他的肉身早已經煙消云散；鄭芝豹也已經全軍覆沒，兵敗雙魚島，引頸就戮；就連泉州港和安平鎮老家也已經淪陷，鄭家在東南的勢力已經不復存在！
鄭芝莞覺得無顏面對幾個堂兄弟，沒有守好他們的家業，走投無路之下也殺生成仁！自此澎湖列島便已成功收復！
一個艦隊留下來守衛澎湖，王必成告訴艦隊指揮官，小姐和參謀長下一步就要打臺灣！這里是主要的前進基地，你們一定要守好這里！隨后他帶領其余兩個艦隊和一部分繳獲的物資，也帶走了大部分海盜船，得勝返回雙嶼島！
從雙嶼島外海的戰役打響開始，到澎湖的收復，歷時三個多月。自此由喻梅萍下達命令，喻錦精心策劃，在喻虎的率領下，三支艦隊加上4個陸上聯隊，發起的這場東南大戰已經完美收官，唯一落網的就是鄭鴻逵，不過也不要緊，此刻的鄭鴻逵早已是驚弓之鳥，喪家之犬，只能流竄逃命，大明已經沒有他們鄭家的立足之地！
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