艦隊直驅虎門。陳海陽決定第一仗就拿下這個珠江要隘、廣州的門戶。虎門在明清二代和現代都屬于東莞縣，外瀕伶仃洋，內聯獅子洋，是一段長約8公里的珠江江面和兩岸地區。此地是珠江要隘，廣州的門戶。在歷史上虎門的安危對廣州的安全有著重要的心理意義，一旦外敵攻占虎門就能夠震動整個廣州。所以這里歷代的設防很是嚴密。盡管虎門要隘從來就沒能抵擋住哪怕一次外敵的正面進攻，不但船堅炮利，有著裝備和戰術優勢的英國人和日本人都曾經突破過這個要隘，連嘉慶時代的中國海盜都曾經輕易的突破過虎門要塞。他知道在1637年英國人威德爾曾經帶著幾條船就摧毀并占領了虎門的亞娘鞋炮臺。以他的兵力來說，占領此地不會花費多大的力氣。
珠江特遣艦隊正在前進的時候，虎門地區的防御已經大大加強了。盡管廣東總兵何如賓被圍在瓊山，王尊德因病不能視事。但是在李逢節、廣東地方官員和明軍將領的努力下，整個虎門地區的防御已經得到了大大加強了。
主持虎門防御的是督理廣州海防參將許廷發、虎門寨海防游擊陳謙和東莞縣令樊文才。虎門在東莞縣境內，樊文才責無旁貸，干脆自己帶著人搬到了虎門寨前的太平鎮上辦公。征發了數千民工在虎門修筑工事。
許廷發是海防宿將，知道虎門的防御非常的薄弱，亞娘鞋島上原來自由一處土石結構的炮臺，還是從萬歷年間起逐漸修筑的，坍塌損壞的地方很多。炮臺上安裝的火炮大多是老舊的大佛郎機炮和發熕炮。不但威力不足，而且平日里露天列放，多有銹蝕。除了亞娘鞋炮臺之外，只在亞娘鞋島對面的上橫檔島上有一處土石炮臺，上面安有大佛郎機炮4位。和亞娘鞋炮臺形成的交叉火力非常微弱。而這兩處炮臺只能勉強控制虎門東水道，西水道沒有任何的設防措施，只在通過上橫檔島之后，在大虎山島南側有一座簡易的大虎炮臺可以勉強阻擋通過西水道的船只。
這三處炮臺，一共只有火炮36位、全是萬歷年間甚至更早的時候鑄造的佛郎機炮和更老的發熕炮。三處炮臺的守軍總計不過120人，只是很簡單的看守大炮和炮臺而已。
除去這三座炮臺之外，明軍可以用來保衛虎門的就是陳謙率領的虎門寨守軍。虎門寨平日里的守軍640名，戰船10艘。船炮120位。
這點兵力攔截客商，嚇阻百姓還差不多。所以真要開戰明軍還要向這里增援。戰時的總兵力將擴充到2000人。許廷發知道髡賊素以船堅炮利著稱，遠非一般海盜可比。所以一面和樊文才會商著手蒸洗舊炮，修復炮臺，一面從佛山等地調運新鑄的紅夷大炮。擴充炮位。
亞娘鞋炮臺上的炮位增加了60位，達到了空前的72位。上橫檔島不但整修了原先的炮臺，還準備增修一座朝向西水道的炮臺。安置12位大炮。大虎山炮臺也擴充了火炮。虎門寨本身增修了土城，準備再安置了18位火炮。
許廷發、樊文才等人著手加固增修炮臺外，還按照孫元化的《西法墩臺》的形制，添修筑西洋炮臺。并且在大角和沙角臨時各修筑一處沙袋土壘炮臺，每處炮臺安置紅夷炮2位，大佛郎機10位。
按照許廷發等人的計劃最后還要在上橫檔島西面的蘆灣沿岸修筑炮臺，與上橫檔島西炮臺形成炮火夾射之勢，這樣就能嚴密的封鎖住西水道。