這朱祁鎮不堪為帝。
除了穩定內部，以及一系列的作戰部署外，于謙還認為，土木堡之戰的失利，犯了許多兵家之大忌，其中后勤保障沒搞好也是重要原因之一。
如20萬明軍長期在風雨中輾轉，軍糧不備，軍械不習，運輸不及時等。
連唯一的飲用水源都被切斷，在人饑馬渴的情況下，是不能打勝仗的。
因此，在于謙上任后，首先實行正確的后勤方略，從人力，物力，財力等各方面積極做好后勤準備。
在人力準備方面，著重整頓，充實京軍。
京軍的主力在土木堡之戰中覆沒后，京城中就只剩下部分守城部隊，于是為了迎接戰斗，于謙開始重組京軍。
他急調兩京，河南的備操軍，沿海的備倭軍，江北及北京諸府運糧的官軍，以及浙江兵來到北京，使京城兵力由數萬人迅速增加到22萬多人，形成了兵力數量上對于瓦剌軍隊的優勢。
除此之外，還派遣監察御史白圭等15名重要官員，前往京畿，山東山西等地招募兵員，進行應急訓練，以備補充。
唐朝李世民時期。
李世民聽得不由點頭“這人力方面的調遣與準備，確實很充分。”
尉遲恭以及程咬金等武將也是連連點頭。
那瓦剌軍繼續南進，如此緊急情況之下，還能做到如此，這于謙之能確實不容小覷，可見這大明也確實氣數未盡。
在武器裝備的籌措方面，于謙也想盡了辦法。
當時，京城軍中僅有十分之一的將士有盔甲，兵器也嚴重不足，為此，于謙一方面命令工部加緊趕制，一方面將南京庫存兵器的三分之二，共126萬件調入北京，以補充守城部隊。
同時還派出人員到土木堡收集明軍潰敗時丟棄的各類裝備武器等，并更換了明軍的戰服以及軍旗等。
在糧食儲備和運輸方面，當時，供應北京的糧食有數百萬石儲備在東郊的通州，可供京師軍民一年的食用，可是由于短期內無法將其運到北京，有人擔心被瓦剌利用，主張將這些糧食燒毀。
但于謙不同意，他認為，這些糧食是寶貴的財富，是京城保衛戰的重要物質基礎，如果沒有糧食，軍隊就會不戰自潰，因此，于謙采用了一切措施運糧。
除官府征用的500輛大車晝夜運糧外，還動員百姓及官兵的家屬，親友自備車輛前往通州運糧。
并且于謙還提出，對運到北京20石以上糧食的人，除運費外，另發白銀一兩，以資鼓勵。
于是重賞之下有勇夫，在于謙的督促下，運糧隊伍川流不息，晝夜往返。
不幾天工夫，就把通州的幾百萬石糧食運進京城并儲備起來，從而使軍心大振，也穩定了民心而在此基礎上，于謙還下令官兵皆預支半年祿餉，眾從皆歡呼雀躍，也更是極大的凝聚了民心
聽到這里，歷朝歷代諸人不禁心生贊嘆。
這種種舉措，真能說一句有先見之明，也有用兵作戰，定國安邦之才能
當然，人力方面不止有充實京城軍隊，于謙還著重發動群眾
他將全城軍民都動員起來，以備戰備荒。
如將城內的木土，瓦匠，石匠等統一編成工程隊，然后來進行訓練。
還籌集了各種工具材料等，組織力量加固周邊城墻，增修了京城九門，加強了城防，同時還命令工部組織人員在城墻堞口設置門扉，在城東、西、南面城墻上綁上沙欄木，進一步增強了北京城池的防御性能。
除此之外，為了進一步發動群眾，于謙還傳檄京城周圍的州縣，以及山西河北等地民眾，拿起武器，視情況打擊瓦剌軍隊，以切斷其后退之路。
而這果真在之后起到了作用在瓦剌軍改為進攻彰義門之時，由于監軍太監率領騎兵沖擊敵陣去搶攻，使得明軍陣勢陷入混亂，瓦剌軍乘勢反擊，追到德勝門外，于此萬分危急關頭，當地居民紛紛登上房頂，以磚石迎戰瓦剌軍。
而后于謙派出的援軍也及時趕到，借此打退了瓦剌軍的反撲。
朱元璋不禁心下震動，軍民一心啊。
不過又是監軍太監
朱元璋皺了皺眉，這宦官太監，當真是要好好思量一番了。
總之，也先在進攻北京的過程中，到處遭到軍民的抵抗和不斷襲擊，各地的百姓民眾自動組織起來，抗擊瓦剌軍的掠奪，而北方邊陲重鎮的守兵們，也抱著與城共存亡的決心，誓死保衛國土。
于是也先進攻北京各門屢次遭到失敗，中路軍在居庸關的進攻也受挫等，之后又獲悉明朝各路援軍即將到達，唯恐后路被切斷，便于十五日夜率一部人馬，挾持明英宗朱祁鎮由良鄉向紫荊關撤退。
但瓦剌軍隊在撤退的路上，還要一路燒殺搶掠，掠奪了許多物資和人口。