崇禎十七年四月初五，比原本歷史早了三日，淮安巡撫路振飛接到塘報，神京陷落。
路振飛在和朱慈烺商議過后將這個消息公布給了當地官紳，并告知南京六部官員。
原本路振飛想要封鎖消息，只叫家丁快馬至南京報與史可法，卻被朱慈烺拒絕了。
神京既已淪陷，消息傳到南面是遲早的事。這種時候封鎖消息不但無甚用處，反而會令當地官紳懼怕，生出許多不必要的麻煩。
稍晚幾日，崇禎帝自縊煤山的消息傳來，永王、定王等皇族也被闖賊俘獲。所幸的是東宮太子殿下順利南渡，已經抵達淮安。
這個消息也被重點散布，使得絕望中的南京六部官員看到了一絲希望。
朱慈烺對于神京陷落、崇禎自縊的消息早有心理準備，路振飛等人卻是一時難以接受，若不是還要主持大局真怕是要垮掉。
恰巧此時福王朱由崧、潞王朱常淓以及周王、恒王都逃難至淮安，暫居于淮安城中西湖咀。朱慈烺便把他們召集，商議赴南京即位的事宜。
這些藩王們得知東宮就在淮安皆是驚訝不已。原本歷史中繼統的兩個熱門人選福王朱由崧和潞王朱常淓此刻都十分堅定的擁護太子繼位，全無政治投機客的嘴臉。
朱慈烺另下了一道令旨，命人送到南京交予史可法。
作為南京兵部尚書，史可法是留都文官中地位最高的，朱慈烺要去南京繼統，自然要找他。
史可法收到朱慈烺的令旨，直是激動不已。原本他就是奏請太子監國的倡議者，現在太子真的南渡，他自然會毫不猶豫的擁戴。
史可法立即召集了六部官員商議太子赴南京的具體方案和細節。
而直到此時，鳳陽總督馬士英才剛剛得知太子就在淮安的消息。
他不禁勃然大怒，對路振飛的‘欺瞞’舉動十分不滿。
然此刻太子對路振飛頗為倚重，他也不好多說什么，只點了一些護衛星夜奔來淮安護駕。
原本歷史上借定策之功飛黃騰達，躍居首輔的馬士英，此刻卻是連喝湯都喝不到了。兵部尚書史可法和禮部尚書王鐸先行一步，于四月十三抵達淮安，而馬士英四月十四才到了淮安城外。
對于這個政治投機客朱慈烺沒有什么好感，但要說厭惡卻也說不上。
有人說馬士英是閹黨，給他貼上一個大大的閹黨標簽。實際上這卻是政治斗爭的結果，說馬士英是閹黨太過勉強。
但既然馬士英已經被貼上一個閹黨的標簽，那么朱慈烺卻可以利用這一點制衡朝堂。
畢竟南京六部官員中東林黨復社的背景太濃重，還是需要一些平衡的。
四月十五日，在兵部尚書史可法、禮部尚書王鐸、鳳陽總督馬士英、淮安巡撫路振飛的陪同下，朱慈烺正式從淮安出發奔赴南京。
四月十八日，太子乘坐的舟船抵達南京城外的燕子磯。南京的留守官員以及縉紳悉數到場迎接。
朱慈烺并沒有直接進城，而是先去拜謁了孝陵。
甲申國變，天子自縊煤山，這個時候太子拜謁孝陵自然帶了一絲不同的意味。