所謂的地底潛行能力，就是當無人機在地表降落，并啟動地底潛行模式之后，無人機的機體會發生一次非常明顯的變形，變成適合在地底潛行的形狀。變形后的無人機模樣大變，不再是B-2隱形轟炸機的模樣，它的前方是一個巨大的、鋒利的、可以快速旋轉的鉆頭，這個鉆頭削鐵如泥，可以快速完成泥土和巖石的挖掘。它的機身是一個摩擦阻力極小的流線型圓柱體，機體下方是兩條巨大的拖拉機履帶。
在進行地底潛行的時候，無人機依靠兩條巨大的拖拉機履帶來提供強大的前進能力。在履帶的帶動下，無人機會向前推進，而機體前方的巨大鉆頭就開始快速旋轉，用來破開前面的泥土和巖石，然后履帶轉動，帶動無人機在地底快速前進。而前面鉆頭挖掘的泥土會被這兩條履帶傳送到無人機后面，讓無人機有足夠的空間能夠前進。
在進行地底潛行的時候，無人機還有一個神奇的地方。那就是駕駛艙里不會出現缺氧的情況，也就是說無人機里面的人永遠不會出現窒息的情況。所以只要無人機能量點足夠多，能夠對抗得了地底的巨大壓力，無人機就可以一直在地底潛行下去。如果能量點消耗完畢，那么無人機就會被卡在地底，無法動彈。
這個地底潛行的功能雖然強大，但是無人機在地底潛行的時候卻非常消耗能量點，是典型的消耗能量點大戶。而且在地底潛行的時候，因為無人機已經切換了形狀，所以幾乎沒有什么戰斗力。除了機頭處的火神炮能夠正常發射之外，其它的戰斗能力全部消失。同時無人機的隱形能力也會全部消失，除非它再次變回原來的B-2外形。
至于無人機的垂直起降和入海潛行能力，基本上和之前沒什么兩樣。硬要說有什么區別的話，那就是無人機在海底的時候也會變形，但是變形后的形狀和之前有很大差異，但都是最適合水底潛行的流線型體。除此之外，當無人機位于海底的時候，它的其它武器會自動消失。在機腹下面會出現一個魚雷發射管，魚雷發射管里只有一種武器，那就是AGM—129隱身巡航導彈。
因為使用環境的改變，AGM—129隱身巡航導彈實際上已經可以被稱為魚雷了。只不過它的威力被進行了縮小，只有在空中使用時候的80%威力。但是因為AGM—129隱身巡航導彈本身威力就非常強大，就算只是剩下80%的實力，也具有非常強大的殺傷力。所以無人機在海底也擁有了攻擊能力，不再像之前那個弱小版的AIM-120空對空導彈那樣，在海底既不中看，又不中用了。
無人機的火神炮在海底也能使用，不過威力就小了很多，基本上達不到消滅敵人武器裝備的水平。不過無人機在海底潛行的時候，也會遇見一些大型海洋生物，對付這些攔路的海洋生物的時候，火神炮就能派上用場了。
最能增強無人機戰斗力的量子雷達也再次得到了提升，它的掃描范圍提升了一倍，從之前的1000公里變成了現在的2000公里。這么遙遠的探測和預警距離，能夠讓無人機在更早的時間里發現來襲的導彈，并提前制定好作戰計劃，做到萬無一失，避免出現不必要的損失。
只是量子雷達雖然厲害了很多，但是開啟它進行大范圍掃描所消耗的能量點也大幅增加。而且這個能量點的消耗隨著距離的增加，以幾何級數的方式快速增加。以無人機現在高達1000萬的能量點，也無法支撐量子雷達進行大范圍、長時間的全面掃描。這也注定了燕飛每次使用量子雷達的時候都要精打細算，以免造成能量點的浪費。