雖然初號機已經被傀儡系統接管，但感官共享其實依舊是開啟的，畢竟還要借用碇真嗣的力量維持at力場，沒有駕駛員的情況下，單獨的傀儡系統能夠維持到at力場非常有限，所以駕駛員與機體之間并非是完全斷開了連接。
碇真嗣本來是想心平氣和的等待著重新建立與初號機之間的連接，但現在發現想要平心靜氣的感受心靈層面的力量，可不容易，外面三號機正在哐哐哐的撞著初號機的腦殼，碇真嗣感覺自己的腦漿子都快要被搖勻了。
也好在他已經解開了基因鎖，即便是只解開一階基因鎖，尋常的痛苦也可以進行主動的屏蔽，某種層面上，對于解開了基因鎖的人來說，身體上的拷問就已經完全無效了。
而隨著碇真嗣解開基因鎖，將痛苦對自身的影響徹底屏蔽，他與初號機之間的聯系也就越發密切，本身就已經解開了三階基因鎖，進入了自己的極限狀態的他，距離真正能夠擁有屬于自己的心靈之光的四階距離已經近了太多，雖然這兩個等級之間有著鴻溝一般的差距，并不是那么容易就能突破的，但模模湖湖的感應到心靈之光的存在已經可以做到了。
初號機和他之間的連線，一直都沒有斷掉，而順著這條連線，碇真嗣已經能夠更加真切的感覺到初號機的運動，而隨著他努力的綻放出自己的心靈力量，他和初號機之間的聯系也變得越來越密切。隨著時間的推移，這種聯系遲早會增強到傀儡系統也無法阻斷的程度。
而這個時候在外面，初號機已經強行掙脫了控制，傀儡系統扭斷了初號機的手臂，這才逃了出來，然而手臂剛剛翻轉，重新接好，三號機就已經跳了過來，隨后專門針對初號機受傷脫臼的那條手臂。
針對著那個方向四只手發動勐攻，現場的場面就是字面意義上的雙拳難敵四手，多了兩條手臂之后，在格斗之中的優勢實在是太大了，就算是初號機的力量和速度都占據絕對優勢，但在技巧層面完全被碾壓的情況下，還是節節敗退剛剛爬起來就被打翻在地，又想爬起來，又被打翻。
場面簡直慘不忍睹。初號機從登場到現在還沒有這么慘過，畢竟這次的初號機一登場就是解開了基因鎖的碇真嗣駕駛，在解開基因鎖的狀態下，初號機一開始的戰斗力就爆炸，在面對所有使徒的時候幾乎都沒吃過虧，可從來沒有像現在這樣幾乎被按在土里打。
所有人都看向碇司令，在場的眾人雖然不能說是格斗行家，但一個個也都是軍隊中的精英。或多或少還是懂一些，就算是下場，未必能比傀儡系統做的好，但也能看出些門道。
這傀儡系統能發揮出來的實力遠遠不如碇真嗣，如果是駕駛員還在線上的話，或許不一定能在單打獨斗中戰勝那個擁有著極其強悍的戰斗技巧的使徒，但至少不會像現在這樣被按在土里摩擦，初號機的腦袋都被撞進山里，現在的樣子可謂凄慘，倒栽蔥的插在山體之中，然后還沒使徒拽著雙腿，瘋狂的用腳踹兩腿之間，像是釘釘子一樣，把它往更深的山體里面踹。
碇真嗣“”
你他喵的故意的是吧別以為我不知道現在是誰在控制三號機啊雖然已經可以免疫劇痛，但這個姿勢也太蛋疼了，那是真正字面意義上的蛋疼。
碇源堂這個時候也陷入了沉默，用自己的手套遮住自己的臉，保證自己在這個過程中不會露出失態的表情。
本來他是準備讓自己的兒子自閉，迫使初號機覺醒，順帶處理掉某個不穩定因素的，保留著上一次輪回記憶的他，有著一次又一次輪回之中的經驗，確信自己能夠成功。
然而那個不穩定因素已經遠遠超出了他的預計，原本準備作為殺手锏的傀儡系統，現在表現的就像是個廢物一樣，繼續這么下去，初號機恐怕都要被拆了。
傀儡系統第一次登場就有了這么糟糕的戰績，估計未來相關的項目恐怕根本沒有機會繼續深入研發下去了。
而就在這時，碇真嗣似乎是因為疼痛和羞憤，終于突破了某個臨界點，一股前所未有強大的at力場，從初號機的身上綻放了出來，將三號機吹飛了出去。
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