不久之前他來到了澳大利亞的nerv總部，將莉莉絲和其他幸存的高層人員運送到這里，剛剛從初號機上離開，就感覺到一陣天旋地轉，然后就來到了海底，并且被包裹在了一個氣泡中同樣被包裹在氣泡中的還有藍諾，曾經熟悉的大叔，此時看起來無比陌生。
這種匪夷所思的力量。簡直比起使徒還要更加離譜。而隨著大叔在眼前的一層屏障上抹了一下，原本具有光學迷彩效果的屏障就那么開出了一個窗口，讓人可以看到里面的一切。
而他所看到的就是里面發生的激烈的戰斗。
那里面任何一個人展現出來的強大實力，都足以將曾經讓人類束手無措的使徒按在土里摩擦，而這樣的存在竟然在地球上發生混戰，這是他根本不敢想象的，如果沒有面前的那一層結界，阻擋了一切攻擊對外界的破壞。脆弱的地球現在恐怕已經被撕碎了吧。
“怎么樣看過之后有什么感想”藍諾詢問身邊的少年，現在也是時候，讓他見識一下這個世界背后的真相了。
碇真嗣臉上的表情一直都是懵逼的，就算是到了現在也完全沒緩過來。
“那究竟是什么在海下發生戰斗的究竟是什么這個世界上還有使徒之外的強大存在嗎還有我剛剛看到了和我駕駛的初號機很像的機甲，但是他卻能夠變成巨龍，而且還殺死了一頭體積是它的上百倍的巨龍，你到底要告訴我些什么你又是什么人”
藍諾并沒有直接回答這個問題，而是將手指點在自己的大腦之上，向外一拉，一條如同柳絮一般的東西被它從腦海之中拉了出來。
“在我告訴你一切之前，你可以先看看這段記憶，這本來應該是屬于你的記憶，但現在你已經全都忘記了。”
碇真嗣疑惑的接過了那一團半透明的乳白色物質，他就像是一縷煙塵一般懸浮在半空中，但隨著他接觸，腦海之中頓時就有大量的記憶浮現上來，那是以他的第一視角經歷的一切。
在記憶之中，自己并沒有現在這般堅強，在被父親送到寄宿制學校后，一直都顯得非常消沉，身邊唯一的伙伴就是自己的核動力隨身聽。
根本沒意識到自己母親的意外之中有什么問題，日子過得渾渾噩噩，而后又莫名其妙的被拉去駕駛初號機。
雖然駕駛機體非常痛苦，但隨著和另外幾位駕駛員相互認識，彼此之間相互相處，一切似乎都朝著好的方向發展，直到入侵的使徒變得越來越強，身邊的伙伴陸續遭受不幸，而他卻無能為力，最終看著明日香駕駛的二號機被量產機分尸，最終徹底陷入崩潰。
而這之后才是重點，他回憶起了曾經自己所經歷的人類補完，也回憶起了曾經自己的決定讓全人類陸續從血紅色的海洋之中清醒過來。
而那時的他是茫然的，是藍諾突然出現，這才讓他找到了方向，讓他認識到人們從海洋之中醒來，只不過是一切的開始，緊接著就又是一段讓他感到無比溫暖的記憶，在那段記憶之中，他一點點建立起自己的家園，似乎真的可以就這樣讓那些溶解在海洋中的人類陸續蘇醒過來，重新恢復人類文明。
在這個過程中，他探索曾經的文明遺跡，找到重要的文明遺物，和阻撓自己的幕后勢力戰斗，一切逐漸朝著好的方向發展。
直到一臺巨大的白色機體出現，而后藍諾展現出了如同自己剛剛看到的那些人那樣逆天的實力，卻依舊無法阻止那臺白色的機體，所有人都融化在了白光之中，而后一切重新開始，重新回到了，也是他這一生的開始。
“這一切原來都只是一個輪回嗎”碇真嗣從回憶之中清醒過來，看向藍諾“不管大叔究竟是從哪里來的，請幫幫我，我想要打破這個輪回，也想要知道世界背后的一切的真像。”
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