歷史上吳有性寫出溫疫論的背景是崇禎末年的大瘟疫，那場瘟疫全國橫行十戶九死，河南、河北、山東、浙江等人口聚集區，“五六月間，一巷百余家，無一家僅免，一門數十口，無一口僅存者”。
一些學者認為滿清能夠成功入關也和這場大瘟疫不無關系，起義軍反復騷擾幾遍都還沒有崩潰的河南河北，清軍一到卻幾乎是望風而降，以大明的情況再怎么樣潰敗的也不會那么快，如果真出現了死亡率這么高的瘟疫倒是比較能夠解釋。
當時的醫生用治傷寒的方法醫治全部失敗，醫生旁皇無措，吳有性也終于悟出不能全信古書的道理，寫下“守古法則不治今病”的判斷，開始研究當時的瘟疫之癥，從頭摸索出一套新的治療方案。
后世學者考證認為這場瘟疫其實就是鼠疫，而且還是海外輸入的新品種。隨著隆慶開海，大量海內外交流自然會帶來新的傳染病。有港口的詔安突然發生前所未見的瘟疫也不是怪事。
王文龍也不知詔安流行的究竟是什么病癥，但是他卻知道控制傳染病的最佳辦法。
王文龍引導說“先生不如試用實驗之思維，雖然詔安大疫，但總有一些人能夠幸存，先生可仔細回憶，其中有無地方幸存者特別多，他們又和別處有何不同”
王文龍說道“這也算是一種實驗，只不過是多場實驗同時進行，有人染病有人幸存，幸存者聚集之處多半因為他們做了什么可以避免染病的辦法。”
他這話一下提醒了吳有性，吳有性皺眉思索“詔安有海港，港中多是青壯，但即使如他們也多有染病的，可見此病厲害，并非身體強壯便能逃過一劫。”
想著想著他突然說道“如此說來倒有一處地方，那是詔安縣一處名為洋尾的村子，我回莆田時經過此村，發現村中幾乎無人染病。”
“此村可是在詔安外圍”
吳有性搖頭說道“地雖偏遠但不是人跡罕至之處，詔安有條東溪，溪水在縣界分成東溪干流和支流滸溪入海，洋尾就在兩溪夾角處，村中常有人到縣中的宮口港去做工的，只不過地震之后，此地交通斷絕，若非行船北上意外擱淺我也不會到這村中。”
吳有性越想越是奇怪“怪哉怪哉，若是地震之后起邪風帶來風寒，那洋尾正當著風口之上，如何別處人都患病，獨獨他村中得以保全”
吳有性還在奇怪而王文龍則是已經反應過來
洋尾村顯然是在河中三角洲地帶，地形也不算平坦，平時只有人口外流到縣中的港口去做事，大災之后交通斷絕自然也沒有多少人回村，傳染病例輸入肯定少。
這時的醫生往往以為傳染病的起源是風邪瘴氣，所以吳有性對于同處一地的一個村莊病人格外少會覺奇怪。
王文龍加以引導問道“這村子地震之后與外界交通斷絕，沒有多少病人到來，是否就是他們村中不染病的原因過去的瘟疫或許是風寒暑濕入體，但也許這次瘟疫卻是從人身上傳入，也許正如風氣寒氣一般，人身上也有一種戾氣，傳入人之口鼻就可使人得病。”
“戾氣說”歷史上就是吳有性指出的，他認為疾病不一定是通過自然環境感染，還可能通過接觸患者感染，而“戾氣”進入人體的途徑是通過口鼻傳入。
吳有性一愣，細細思索王文龍所說的可能性，然后便越想越驚訝。
“或許正是如此”吳有性激動說道，“也許正是這一種戾氣存在，這氣息無聲無臭，人不知是氣，稍聞之下就染疫病。”