前文曾提過，總督府麾下的艦娘，被小蘿莉粗曠地劃分成了本部、支部和分部，可這種分類方式，更多只是為了劃分遠近關系與指揮職權，與艦娘的實力并無太大的關聯。
因此，沐云才會進行干涉，在建立起六大序列的同時，將支部和分部的艦娘一同納入其中。
除核心序列不再細分，學員與見習生則獨立劃分為初始后備的獨立序列以外，王牌、主力、支援、守備、后備等五個序列，均劃分為上中下位，后備序列更將其劃分成一二三等。
如此一來，核心序列一級，王牌序列三級，主力序列三級，支援序列三級，守備序列三級，后備序列九級，外加獨立的初始后備序列，一共二十三級。
總督府本部的上限為二十三級，擁有完整的六大序列，而支部這邊卻只有十九級，沒有核心序列的編制，后備序列也減少為六級。至于分部的部份則進一步緊縮，只有十六級的上限，一樣沒有核心序列，而后備序列也再次減少，只剩下三級。
因此，在實力與權限方面，分部的上位王牌級艦娘，等同于支部的上位主力級艦娘，而支部的上位王牌級艦娘，則于本部的上位主力級艦娘相等，以此類推。
至于權限與級數的升降，全憑艦娘的實力說話，依照比例原則來調整。
在立下規矩以后，沐云以后招募到的艦娘，在實力達到本部的下位支援級層次之后，就必須前往分部坐鎮歷練，直到實力提升至中位支援級，并有其他剛提升至下位支援級的艦娘頂替為止。
同樣的，當本部的艦娘的實力提升至下位主力級層次時，亦需要前往支部坐鎮歷練，直到實力提升至中位主力級，并有其他剛提升至下位主力級的艦娘頂替為止。
至于支部艦娘的部份，在實力達到下位主力和下位支援級的時候，亦需要前往分部歷練，作為分部的中高層戰力。
相較于艦娘，提督的部份就沒有這么復雜，基本上維持既有的編制，僅區分本部、支部和分部。
隨著總部的晉升，特本部與直本部的成立，以及獨立本部的開辟權限以后，總督府的體制也有了進一步的變化。
總部的部分，將核心序列從一級擴展至四級，由上而下分別為絕對核心、戰略核心、戰術核心與準核心。
也就是說，總部的六大序列，共計二十六級，比本部要多三級。
核心序列的級數增加，也就意味著核心序列的編制擴大。
前文雖曾提過，核心序列的編制往往在十名以下，但也曾提過，會有這樣的情況發生，更多是因為資源不足的關系，核心序列本身，其實并無編制方面的限制。
不過，核心序列的排名越靠前，成為婚艦的概率越高，這點倒是一致的。
武藏和法迪默等艦娘，爭的就是其核心序列的比序排名。
艦娘的體制如此，提督的體制亦然，隨著特本部與直本部的組建，其體制也跟著完善了起來。
除完成相應考核并被提拔到上級單位的提督以外，佐級提督均留在分部，然后晉升至校級提督以后才能調至支部，亦或在獲得相應權限以后，開辟特支部或獨立支部。