雖然沒有得到波克比的蛋，但玄間此行也算收獲頗豐，不但收服了一隊極有價值的化石神奇寶貝，燭光靈也成功進化成了燈火幽靈。找了個地方住下后，玄間和翔太立刻對化石精靈們進行了一些研究，撰寫了一篇分量十足的論文后，才將它們傳送給大木博士。這些精靈中，玄間打算重點培養的只有化石翼龍，不過化石翼龍對于玄間使用群毆將它打敗不服，因此玄間和它約定以后正式打敗它才算收服。至于現在，化石翼龍需要先回復一下上萬年沒活動的身體。
由于全身心投入了研究中，玄間對精靈們自然有些疏忽，沒注意到妙蛙種子的異常。直到一天早上索羅亞慌慌張張跑來告訴玄間妙蛙種子丟失了，玄間這才意識到自己的疏忽。
“什么時候不見了的。”玄間急忙問道。
“應該是今天早上，我昨天晚上還見到它呢”多軌說道，“妙蛙種子這兩天食欲一直不好，我給它換了很多口味，但都效果不理想。”
“都是我不好，我這幾天冷落了它，對它太不關心了都是我的錯”玄間懊惱地說。
翔太連忙安慰道“別急，我們先去現場看看。”隨后便帶頭來到了妙蛙種子的臥室中。
此時，玄間已經強迫自己冷靜下來，仔細的查看了一番臥室，并未發現外部入侵的跡象，如此一來，妙蛙種子被人搶走的可能被排除了。
“室內殘留著催眠粉，從成分上分析很可能是妙蛙種子發出的，窗臺上有藤鞭的勒痕和腳印，也是妙蛙種子留下的，在我看來，可能是妙蛙種子自己離開了。”翔太說著自己的調查結果。
“可是妙蛙種子為什么要離開呢僅僅是玄間這幾天的冷落應該不至于吧”多軌提出了疑惑。
“也許可以問一問其他精靈，看看它們知不知道原因。”翔太提議道。
玄間立刻照做，但詢問了半天，連和妙蛙種子關系最好的索羅亞都表示不清楚妙蛙種子離開的原因。難道真是因為自己冷落了它嗎玄間一時間沮喪極了。
多軌看出了玄間的沮喪，連忙提醒道“不管怎么說，先將妙蛙種子找回來再說其他的”
“對，”玄間醒悟過來，連連點頭“沒錯，妙蛙種子在外邊很可能遇到危險，我們必須要將它找回來。可是要怎么辦呢”
翔太望著方寸大亂的玄間搖了搖頭，平時多么果決多智的一個人，現在居然如此六神無主，真是關心則亂啊想了想，翔太說出了自己的建議“如果能夠有一只擅長追蹤的精靈幫忙就好了”
“那我們找君莎吧君莎的卡蒂狗嗅覺非常靈敏，應該能很快幫助我們找到卡蒂狗的”多軌說道。
深吸了一口氣，玄間讓自己恢復了冷靜，說道“不，君莎的工作很忙，即使她有空，我們也不知道妙蛙種子跑到了哪里，是否還在她的轄區，這樣會很麻煩。用卡蒂狗追蹤妙蛙種子是好主意，但我們不一定要找君莎。”
“可是我們似乎不認識其他擁有卡蒂狗的訓練家啊”多軌說道。
“不，我剛好有個人選，而且他現在一定有空”
“你說的能幫上忙的人居然是這幾個家伙，可沒看到他們有卡蒂狗啊”多軌看著前方正在尾隨小智一行人的火箭隊三人組，疑惑道。
“放心吧，我有把握我們上去大哥招呼吧”玄間說道，要說擁有卡蒂狗，還能借來用的人，玄間認識的只有小茂和小次郎，小茂開著車到處跑不好找，而小次郎的話只要找到小智就可以了。至于找到小智，對于知道其旅行路線的玄間完全不是問題。
“武藏、小次郎、喵喵，你們好啊好久不見。”玄間走了上去，對正在鬼鬼祟祟跟蹤小智三人的火箭隊三人組打了個招呼。
“玄間大人。”三人組嚇了一跳，不過看清來人后放松了下來。