“大哥，你就不怕他們來者不善”鄭芝豹有點擔心地問道。
鄭芝龍聽了，當即搖頭道“既然是皇帝的密旨，就不可能來者不善，要不然，旨意肯定轉中丞大人那邊，由中丞大人來安排，而不是直奔這里”
他的心中，其實也是非常奇怪，從來就沒有直接聯系的皇帝，竟然會給他一道密旨。讓從未接過圣旨的他，不由得有點新鮮和期待。
另外，他也知道，一直躲下去也不是辦法，中丞大人那邊，肯定已經很惱怒了。除非自己是決心和朝廷翻臉，要不然的話，就不能再一直躲下去的。
于是，過了半個時辰左右，他一身汗地出現在前院，匆匆趕去大堂，姿態放得非常低，連聲稱罪，同時主動解釋道“大員的那些紅夷不安份，不得已，末將親自趕過去收拾了他們一頓。回來晚了，還請諸位大人見諒”
紅夷和大明的關系一直是算敵對的，他這么說，相信也沒人能戳穿這個借口。
錦衣衛總旗在鄭府內好吃好喝地伺候了一頓，緩解了那種悶熱之感，心情已經沒有那么糟了。此時又看到鄭芝龍會來事，姿態放得那么低，心中多了一點好感，也就沒有為難他，便讓他把不相關的人都清退出去，就把密旨給了他。
鄭芝龍心中好奇之下，展開密旨看了起來。
雖然他猜著應該不是壞事，可當他看了一會后，那額頭得汗，又重新流了下來，就猶如他剛從外面進來一般。同時，他的臉上都是震驚之色。
原來，崇禎皇帝在這道密旨里面，就直接開門見山地跟他說了。
主要內容就是說皇帝是知道他鄭芝龍在海上的實力，也知道他在干什么勾當。不過念在他并沒有像北地晉商那樣為禍大明，從某個方面上來說，他鄭芝龍還維護了大明沿海的平安。因此，對于鄭芝龍以前的那些事情，皇帝都不打算追究了。
但是，崇禎皇帝在密旨中警告鄭芝龍，像這種要海船交錢掛鄭家令旗的事情，就別指望著能一直干下去，這是朝廷律法不允許，也是他崇禎皇帝所不允許的。
水師是大明的水師，不是鄭家的水師；大海是大明的大海，不是鄭家的大海；這種事情，真要認真追究起來，就也是有謀逆的嫌疑
崇禎皇帝在密旨中明確告訴鄭芝龍，不久的將來，朝廷一定會關注海上。到時候，不止是福建水師一支，還會陸續重建登萊水師，蘇浙水師，和廣東水師；并且大明水師的目標，也不再只是巡哨沿海。海的盡頭，也得有大明水師的旗幟
而他鄭芝龍唯一的出路，就是趁如今大明水師還在重建之初，給予朝廷最大的助力。唯有如此，方能論功行賞，封妻蔭子，封侯賜爵也是可期的。
如今，為對付遼東建虜，登萊水師要盡快重建。因此，調他鄭芝龍去加速重建，消滅建虜的水師，就是大功一件。而福建這邊，也可以給他鄭芝龍三年時間的緩沖。之后，就要逐步納入朝廷水師的正規編制，而不再只是他鄭芝龍的水師
同時，崇禎皇帝也明確表示，他已經給了足夠的耐心，希望鄭芝龍不要執迷不悟。除非他是想造反，否則就不要錯過這次機會。封他為登萊水師總兵官，立刻領水師北上，聽從保定總督調遣，重建登萊水師，在對虜戰事中發揮他該有的作用
在密旨的最后，崇禎皇帝還表示很欣賞他兒子鄭森，讓鄭森北上京師國子監就讀，并為太子伴讀。
鄭芝龍看完這道圣旨，還是沒有察覺自己已經汗如雨下。他明白，這道密旨其實是崇禎皇帝最后的通牒，要么服從調遣，要么就造反，只有這么兩條路可選。
雖然是最后通牒，可從這份密旨中，他也感覺到了皇帝對他的苦口婆心，希望他能做出正確地選擇。去掙一個封妻蔭子，封侯賜爵；要不然的話，就只有刀兵相見。
與此同時，鄭芝龍也很吃驚。因為崇禎皇帝在這份密旨中，直白地說了他的雄心壯志海的盡頭，也得有大明水師的旗幟這樣的愿望，是以前的皇帝從來沒有過的。
作為在海上起家的大明人，自然知道在永樂年間，朝廷水師一次次下西洋的事情。皇帝一旦真得下了決心，以前的盛況，搞不好就真可能出現。當然了，前提是解決如今國內的麻煩。
鄭芝龍不傻，可以說是相當精明，因此，他明白，不要看他如今有三千條各色船只。可是，如果他一旦選擇真得造反，那么他手下還有沒有三千條各色船只，就不好說了。另外，沒有了陸地的支撐，他比起當年的汪直，其實也并沒有多厲害。汪直最終的結果，就擺在那里。他鄭芝龍的下場最終如何，他也不樂觀。
至少就目前的鄭芝龍來說，他還沒有和朝廷翻臉的思想準備。