作為一地下建筑，菲尼克斯研究所并沒有像地面上的那些“現代”建筑般把自己的結構玩出花來。從地圖上可以看出，這座研究所的基本結構就是一根直徑達到百米級的大圓柱而已。
這根圓柱的圓心就是包括貨運電梯在內的各種電梯，所組成的一個宛如支撐柱般的小圓柱。除此之外，在圓柱的邊緣地帶，則分布著一些用于緊急疏散，但平時基本派不上用場的樓梯——除了只連接B7層和B8層的那一個樓梯。
這個研究所總共有十四層，每個樓層都有不同的房間和布局，擁有并起到不盡相同的功能和作用。但大致上可以被劃分為七個區域，分別是B1層的對外窗口，B2層的防衛警戒，B3到B6層的基礎研究，B7層和B8層的娛樂休息，B9到B12層的核心研究，B13層的管理中樞，以及B14層的保管庫房。
雖然說B3到B6層進行的是基礎研究，也就是一些大型項目中不可缺少但又基礎繁雜的部分，比如為了盡可能消除誤差和偶然的各種重復試驗等等。不過，由于從這些基礎中可以推導出大致的研究目標和路線，所以也是不能隨意外包出去的。
簡單來說，這四個樓層中的實驗就是各個研究所中，被導師使喚的“科研狗”們所需要完成的辛苦工作。
但相比起B9到B12層的真正核心實驗，這些基礎實驗都是可以被“犧牲”的：即使真的被敵人奪取，也不會導致整個項目的徹底失敗。
更何況，其實那些基礎實驗中有不少是誤導他人的不必要操作。
雖說看似費盡心機，不過想一想此刻的現狀，到現在情況還依舊被控制在研究所的范圍內，還真的得感謝他們的這些舉措。
也正因為如此，B7層和B8層不僅僅用于休息和娛樂，還有幾乎名存實亡的聚餐——相比起按時去餐廳吃飯，各種方便食品是更好的選擇——更為重要的作用便是將核心研究，還有更為重要的管理中樞與保管庫房，與前幾層給分隔開來。
所以，除了一部只有得到許可并被全程360度監視后，才會從平時一直待在B14層的電梯上升到B1層運送貨物，在B7層到B2層的范圍內沒有任何出入口，同時內部還有各種機槍、毒氣等防衛措施的貨運電梯外，就只有連通著B7層和B8層的那唯一一個樓梯可以前往下方的樓層。
如果黑人大叔的小隊并不是從B7層中找到的，這種充滿了戲劇性的可能性外，那么最有可能的便是從下方的樓層中找到那關鍵的“一環”。
而從黑人大叔到死也在念叨的存在，必定重要到不會被這支小隊隨意放棄，甚至很有可能就是他們任務的目標之一：中樞電腦主板，或者某實驗的樣品。
更何況現在被遺失在B7層，可以肯定是由于他們遭遇了無法抵抗，甚至連返身都做不到的突發狀況，也就是“罪”的爆發。
毫無疑問，在那種狀況下，這支小隊一定會選擇能夠最快重返站臺的路線！
當然，恩奇都也已經做好了將整個B7層全部搜一遍的心理準備就是了——
沒有任務指示器的現實，真是一個爛透了的垃圾游戲！